Protein–RNA interactions for Protein: Q14153

FAM53B, Protein FAM53B, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53BQ14153 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
FAM53BQ14153 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FAM53BQ14153 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FAM53BQ14153 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FAM53BQ14153 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FAM53BQ14153 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FAM53BQ14153 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FAM53BQ14153 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FAM53BQ14153 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FAM53BQ14153 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FAM53BQ14153 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FAM53BQ14153 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FAM53BQ14153 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FAM53BQ14153 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FAM53BQ14153 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FAM53BQ14153 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FAM53BQ14153 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FAM53BQ14153 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
FAM53BQ14153 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FAM53BQ14153 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
FAM53BQ14153 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FAM53BQ14153 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
FAM53BQ14153 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
FAM53BQ14153 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
FAM53BQ14153 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
FAM53BQ14153 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
FAM53BQ14153 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM53BQ14153 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM53BQ14153 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM53BQ14153 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM53BQ14153 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM53BQ14153 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM53BQ14153 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM53BQ14153 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM53BQ14153 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM53BQ14153 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM53BQ14153 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM53BQ14153 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM53BQ14153 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM53BQ14153 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM53BQ14153 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM53BQ14153 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM53BQ14153 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FAM53BQ14153 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FAM53BQ14153 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FAM53BQ14153 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FAM53BQ14153 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FAM53BQ14153 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FAM53BQ14153 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FAM53BQ14153 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FAM53BQ14153 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FAM53BQ14153 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FAM53BQ14153 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FAM53BQ14153 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FAM53BQ14153 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FAM53BQ14153 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FAM53BQ14153 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FAM53BQ14153 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FAM53BQ14153 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
FAM53BQ14153 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FAM53BQ14153 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FAM53BQ14153 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FAM53BQ14153 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FAM53BQ14153 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FAM53BQ14153 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FAM53BQ14153 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
FAM53BQ14153 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FAM53BQ14153 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FAM53BQ14153 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FAM53BQ14153 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
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FAM53BQ14153 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FAM53BQ14153 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
FAM53BQ14153 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FAM53BQ14153 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FAM53BQ14153 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FAM53BQ14153 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM53BQ14153 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM53BQ14153 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM53BQ14153 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM53BQ14153 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM53BQ14153 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM53BQ14153 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM53BQ14153 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM53BQ14153 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM53BQ14153 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM53BQ14153 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM53BQ14153 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM53BQ14153 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM53BQ14153 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM53BQ14153 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM53BQ14153 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM53BQ14153 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM53BQ14153 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM53BQ14153 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM53BQ14153 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM53BQ14153 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM53BQ14153 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
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