Protein–RNA interactions for Protein: Q14088

RAB33A, Ras-related protein Rab-33A, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB33AQ14088 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB33AQ14088 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB33AQ14088 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB33AQ14088 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB33AQ14088 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB33AQ14088 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB33AQ14088 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB33AQ14088 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB33AQ14088 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB33AQ14088 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB33AQ14088 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB33AQ14088 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB33AQ14088 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB33AQ14088 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB33AQ14088 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB33AQ14088 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB33AQ14088 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB33AQ14088 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB33AQ14088 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB33AQ14088 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB33AQ14088 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB33AQ14088 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB33AQ14088 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB33AQ14088 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB33AQ14088 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB33AQ14088 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB33AQ14088 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB33AQ14088 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB33AQ14088 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB33AQ14088 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB33AQ14088 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB33AQ14088 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB33AQ14088 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB33AQ14088 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB33AQ14088 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB33AQ14088 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB33AQ14088 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB33AQ14088 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB33AQ14088 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB33AQ14088 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB33AQ14088 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB33AQ14088 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB33AQ14088 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB33AQ14088 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB33AQ14088 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB33AQ14088 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB33AQ14088 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB33AQ14088 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB33AQ14088 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB33AQ14088 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB33AQ14088 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB33AQ14088 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB33AQ14088 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB33AQ14088 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB33AQ14088 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB33AQ14088 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB33AQ14088 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB33AQ14088 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB33AQ14088 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB33AQ14088 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB33AQ14088 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB33AQ14088 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB33AQ14088 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB33AQ14088 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB33AQ14088 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB33AQ14088 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB33AQ14088 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB33AQ14088 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB33AQ14088 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB33AQ14088 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB33AQ14088 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB33AQ14088 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB33AQ14088 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB33AQ14088 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB33AQ14088 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB33AQ14088 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB33AQ14088 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB33AQ14088 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB33AQ14088 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB33AQ14088 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB33AQ14088 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB33AQ14088 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB33AQ14088 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB33AQ14088 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB33AQ14088 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB33AQ14088 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RAB33AQ14088 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RAB33AQ14088 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB33AQ14088 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB33AQ14088 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB33AQ14088 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB33AQ14088 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB33AQ14088 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB33AQ14088 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB33AQ14088 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB33AQ14088 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB33AQ14088 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB33AQ14088 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB33AQ14088 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB33AQ14088 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms