Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CBFBQ13951 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CBFBQ13951 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CBFBQ13951 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CBFBQ13951 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CBFBQ13951 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CBFBQ13951 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CBFBQ13951 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CBFBQ13951 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CBFBQ13951 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CBFBQ13951 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CBFBQ13951 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CBFBQ13951 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CBFBQ13951 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CBFBQ13951 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CBFBQ13951 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CBFBQ13951 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CBFBQ13951 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CBFBQ13951 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CBFBQ13951 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CBFBQ13951 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CBFBQ13951 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CBFBQ13951 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CBFBQ13951 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CBFBQ13951 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CBFBQ13951 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CBFBQ13951 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CBFBQ13951 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CBFBQ13951 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CBFBQ13951 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CBFBQ13951 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CBFBQ13951 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CBFBQ13951 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CBFBQ13951 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CBFBQ13951 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CBFBQ13951 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CBFBQ13951 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CBFBQ13951 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CBFBQ13951 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CBFBQ13951 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CBFBQ13951 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CBFBQ13951 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CBFBQ13951 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CBFBQ13951 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CBFBQ13951 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CBFBQ13951 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CBFBQ13951 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CBFBQ13951 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CBFBQ13951 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CBFBQ13951 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CBFBQ13951 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CBFBQ13951 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CBFBQ13951 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CBFBQ13951 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CBFBQ13951 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CBFBQ13951 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CBFBQ13951 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CBFBQ13951 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CBFBQ13951 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CBFBQ13951 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CBFBQ13951 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CBFBQ13951 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CBFBQ13951 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CBFBQ13951 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CBFBQ13951 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CBFBQ13951 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CBFBQ13951 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CBFBQ13951 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CBFBQ13951 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CBFBQ13951 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CBFBQ13951 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CBFBQ13951 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CBFBQ13951 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CBFBQ13951 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CBFBQ13951 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CBFBQ13951 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CBFBQ13951 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CBFBQ13951 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CBFBQ13951 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CBFBQ13951 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CBFBQ13951 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CBFBQ13951 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CBFBQ13951 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CBFBQ13951 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CBFBQ13951 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CBFBQ13951 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CBFBQ13951 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CBFBQ13951 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CBFBQ13951 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CBFBQ13951 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CBFBQ13951 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CBFBQ13951 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CBFBQ13951 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CBFBQ13951 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CBFBQ13951 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CBFBQ13951 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CBFBQ13951 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CBFBQ13951 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CBFBQ13951 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CBFBQ13951 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms