Protein–RNA interactions for Protein: Q13950

RUNX2, Runt-related transcription factor 2, humanhuman

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Length 521 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX2Q13950 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RUNX2Q13950 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RUNX2Q13950 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
RUNX2Q13950 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
RUNX2Q13950 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RUNX2Q13950 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RUNX2Q13950 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RUNX2Q13950 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RUNX2Q13950 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RUNX2Q13950 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RUNX2Q13950 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RUNX2Q13950 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RUNX2Q13950 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
RUNX2Q13950 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RUNX2Q13950 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RUNX2Q13950 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RUNX2Q13950 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RUNX2Q13950 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RUNX2Q13950 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RUNX2Q13950 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RUNX2Q13950 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RUNX2Q13950 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RUNX2Q13950 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RUNX2Q13950 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RUNX2Q13950 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RUNX2Q13950 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RUNX2Q13950 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RUNX2Q13950 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RUNX2Q13950 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RUNX2Q13950 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RUNX2Q13950 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
RUNX2Q13950 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
RUNX2Q13950 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RUNX2Q13950 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RUNX2Q13950 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RUNX2Q13950 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RUNX2Q13950 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RUNX2Q13950 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RUNX2Q13950 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RUNX2Q13950 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RUNX2Q13950 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RUNX2Q13950 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RUNX2Q13950 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RUNX2Q13950 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
RUNX2Q13950 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RUNX2Q13950 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RUNX2Q13950 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RUNX2Q13950 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RUNX2Q13950 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RUNX2Q13950 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RUNX2Q13950 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RUNX2Q13950 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RUNX2Q13950 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RUNX2Q13950 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RUNX2Q13950 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RUNX2Q13950 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RUNX2Q13950 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RUNX2Q13950 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RUNX2Q13950 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RUNX2Q13950 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RUNX2Q13950 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RUNX2Q13950 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RUNX2Q13950 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RUNX2Q13950 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RUNX2Q13950 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RUNX2Q13950 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RUNX2Q13950 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RUNX2Q13950 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RUNX2Q13950 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RUNX2Q13950 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RUNX2Q13950 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RUNX2Q13950 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RUNX2Q13950 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RUNX2Q13950 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RUNX2Q13950 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RUNX2Q13950 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
RUNX2Q13950 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
RUNX2Q13950 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RUNX2Q13950 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RUNX2Q13950 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RUNX2Q13950 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RUNX2Q13950 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RUNX2Q13950 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RUNX2Q13950 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RUNX2Q13950 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
RUNX2Q13950 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
RUNX2Q13950 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
RUNX2Q13950 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
RUNX2Q13950 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RUNX2Q13950 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RUNX2Q13950 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RUNX2Q13950 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RUNX2Q13950 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RUNX2Q13950 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RUNX2Q13950 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RUNX2Q13950 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RUNX2Q13950 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RUNX2Q13950 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RUNX2Q13950 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RUNX2Q13950 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
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