Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CACNA1SQ13698 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CACNA1SQ13698 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CACNA1SQ13698 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CACNA1SQ13698 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CACNA1SQ13698 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CACNA1SQ13698 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CACNA1SQ13698 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CACNA1SQ13698 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CACNA1SQ13698 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CACNA1SQ13698 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CACNA1SQ13698 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CACNA1SQ13698 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CACNA1SQ13698 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CACNA1SQ13698 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CACNA1SQ13698 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CACNA1SQ13698 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CACNA1SQ13698 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CACNA1SQ13698 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CACNA1SQ13698 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CACNA1SQ13698 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CACNA1SQ13698 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CACNA1SQ13698 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CACNA1SQ13698 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CACNA1SQ13698 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CACNA1SQ13698 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CACNA1SQ13698 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CACNA1SQ13698 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CACNA1SQ13698 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CACNA1SQ13698 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CACNA1SQ13698 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CACNA1SQ13698 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CACNA1SQ13698 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CACNA1SQ13698 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CACNA1SQ13698 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CACNA1SQ13698 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CACNA1SQ13698 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CACNA1SQ13698 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CACNA1SQ13698 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CACNA1SQ13698 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CACNA1SQ13698 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CACNA1SQ13698 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CACNA1SQ13698 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CACNA1SQ13698 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CACNA1SQ13698 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CACNA1SQ13698 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CACNA1SQ13698 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CACNA1SQ13698 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CACNA1SQ13698 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CACNA1SQ13698 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CACNA1SQ13698 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CACNA1SQ13698 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CACNA1SQ13698 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CACNA1SQ13698 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CACNA1SQ13698 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CACNA1SQ13698 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CACNA1SQ13698 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CACNA1SQ13698 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CACNA1SQ13698 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CACNA1SQ13698 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CACNA1SQ13698 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CACNA1SQ13698 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CACNA1SQ13698 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CACNA1SQ13698 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CACNA1SQ13698 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CACNA1SQ13698 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CACNA1SQ13698 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CACNA1SQ13698 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CACNA1SQ13698 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CACNA1SQ13698 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CACNA1SQ13698 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CACNA1SQ13698 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CACNA1SQ13698 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CACNA1SQ13698 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CACNA1SQ13698 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CACNA1SQ13698 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CACNA1SQ13698 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CACNA1SQ13698 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CACNA1SQ13698 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CACNA1SQ13698 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CACNA1SQ13698 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CACNA1SQ13698 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CACNA1SQ13698 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CACNA1SQ13698 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CACNA1SQ13698 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CACNA1SQ13698 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CACNA1SQ13698 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CACNA1SQ13698 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CACNA1SQ13698 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CACNA1SQ13698 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CACNA1SQ13698 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CACNA1SQ13698 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CACNA1SQ13698 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CACNA1SQ13698 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CACNA1SQ13698 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CACNA1SQ13698 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CACNA1SQ13698 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CACNA1SQ13698 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CACNA1SQ13698 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CACNA1SQ13698 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
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