Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
HTR4Q13639 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HTR4Q13639 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HTR4Q13639 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HTR4Q13639 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HTR4Q13639 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HTR4Q13639 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HTR4Q13639 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HTR4Q13639 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HTR4Q13639 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HTR4Q13639 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HTR4Q13639 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
HTR4Q13639 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HTR4Q13639 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HTR4Q13639 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HTR4Q13639 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HTR4Q13639 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HTR4Q13639 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HTR4Q13639 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HTR4Q13639 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HTR4Q13639 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HTR4Q13639 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HTR4Q13639 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HTR4Q13639 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HTR4Q13639 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HTR4Q13639 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HTR4Q13639 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HTR4Q13639 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HTR4Q13639 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HTR4Q13639 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HTR4Q13639 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HTR4Q13639 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HTR4Q13639 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HTR4Q13639 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HTR4Q13639 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HTR4Q13639 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HTR4Q13639 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HTR4Q13639 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HTR4Q13639 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HTR4Q13639 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HTR4Q13639 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HTR4Q13639 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HTR4Q13639 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HTR4Q13639 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
HTR4Q13639 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
HTR4Q13639 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HTR4Q13639 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HTR4Q13639 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HTR4Q13639 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HTR4Q13639 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
HTR4Q13639 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HTR4Q13639 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HTR4Q13639 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HTR4Q13639 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HTR4Q13639 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HTR4Q13639 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HTR4Q13639 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
HTR4Q13639 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HTR4Q13639 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HTR4Q13639 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HTR4Q13639 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HTR4Q13639 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HTR4Q13639 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HTR4Q13639 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HTR4Q13639 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HTR4Q13639 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HTR4Q13639 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HTR4Q13639 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HTR4Q13639 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HTR4Q13639 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HTR4Q13639 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HTR4Q13639 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HTR4Q13639 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HTR4Q13639 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HTR4Q13639 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HTR4Q13639 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HTR4Q13639 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HTR4Q13639 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HTR4Q13639 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HTR4Q13639 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HTR4Q13639 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HTR4Q13639 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HTR4Q13639 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HTR4Q13639 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HTR4Q13639 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HTR4Q13639 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HTR4Q13639 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HTR4Q13639 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HTR4Q13639 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HTR4Q13639 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HTR4Q13639 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HTR4Q13639 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HTR4Q13639 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HTR4Q13639 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HTR4Q13639 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HTR4Q13639 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HTR4Q13639 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HTR4Q13639 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HTR4Q13639 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HTR4Q13639 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
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