Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CUL1Q13616 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CUL1Q13616 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CUL1Q13616 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CUL1Q13616 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CUL1Q13616 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CUL1Q13616 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CUL1Q13616 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CUL1Q13616 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CUL1Q13616 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CUL1Q13616 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CUL1Q13616 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CUL1Q13616 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CUL1Q13616 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CUL1Q13616 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CUL1Q13616 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CUL1Q13616 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CUL1Q13616 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CUL1Q13616 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CUL1Q13616 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CUL1Q13616 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CUL1Q13616 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CUL1Q13616 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CUL1Q13616 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CUL1Q13616 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CUL1Q13616 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CUL1Q13616 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CUL1Q13616 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CUL1Q13616 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CUL1Q13616 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CUL1Q13616 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CUL1Q13616 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CUL1Q13616 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CUL1Q13616 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CUL1Q13616 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CUL1Q13616 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CUL1Q13616 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CUL1Q13616 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CUL1Q13616 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CUL1Q13616 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CUL1Q13616 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CUL1Q13616 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CUL1Q13616 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CUL1Q13616 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CUL1Q13616 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CUL1Q13616 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CUL1Q13616 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CUL1Q13616 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CUL1Q13616 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CUL1Q13616 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CUL1Q13616 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CUL1Q13616 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CUL1Q13616 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CUL1Q13616 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CUL1Q13616 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CUL1Q13616 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CUL1Q13616 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CUL1Q13616 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CUL1Q13616 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CUL1Q13616 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CUL1Q13616 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CUL1Q13616 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CUL1Q13616 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CUL1Q13616 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CUL1Q13616 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CUL1Q13616 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CUL1Q13616 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CUL1Q13616 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CUL1Q13616 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CUL1Q13616 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CUL1Q13616 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CUL1Q13616 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CUL1Q13616 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CUL1Q13616 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CUL1Q13616 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CUL1Q13616 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CUL1Q13616 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CUL1Q13616 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CUL1Q13616 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CUL1Q13616 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CUL1Q13616 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CUL1Q13616 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CUL1Q13616 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CUL1Q13616 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CUL1Q13616 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CUL1Q13616 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CUL1Q13616 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CUL1Q13616 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CUL1Q13616 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CUL1Q13616 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CUL1Q13616 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CUL1Q13616 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CUL1Q13616 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CUL1Q13616 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CUL1Q13616 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CUL1Q13616 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CUL1Q13616 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CUL1Q13616 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CUL1Q13616 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CUL1Q13616 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
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