Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PEX6Q13608 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PEX6Q13608 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PEX6Q13608 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PEX6Q13608 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PEX6Q13608 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PEX6Q13608 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PEX6Q13608 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PEX6Q13608 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PEX6Q13608 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PEX6Q13608 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PEX6Q13608 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PEX6Q13608 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PEX6Q13608 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PEX6Q13608 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PEX6Q13608 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PEX6Q13608 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
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PEX6Q13608 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PEX6Q13608 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PEX6Q13608 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PEX6Q13608 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PEX6Q13608 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PEX6Q13608 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PEX6Q13608 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
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PEX6Q13608 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PEX6Q13608 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PEX6Q13608 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PEX6Q13608 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PEX6Q13608 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PEX6Q13608 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PEX6Q13608 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PEX6Q13608 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PEX6Q13608 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PEX6Q13608 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PEX6Q13608 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PEX6Q13608 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PEX6Q13608 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
PEX6Q13608 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PEX6Q13608 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PEX6Q13608 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PEX6Q13608 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
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PEX6Q13608 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
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PEX6Q13608 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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PEX6Q13608 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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PEX6Q13608 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PEX6Q13608 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PEX6Q13608 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
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PEX6Q13608 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
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PEX6Q13608 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PEX6Q13608 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PEX6Q13608 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PEX6Q13608 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PEX6Q13608 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PEX6Q13608 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PEX6Q13608 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PEX6Q13608 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PEX6Q13608 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PEX6Q13608 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PEX6Q13608 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
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PEX6Q13608 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
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