Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
PKD2Q13563 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC32.34■■■□□ 2.77
PKD2Q13563 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
PKD2Q13563 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
PKD2Q13563 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
PKD2Q13563 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
PKD2Q13563 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
PKD2Q13563 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
PKD2Q13563 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
PKD2Q13563 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
PKD2Q13563 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
PKD2Q13563 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
PKD2Q13563 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
PKD2Q13563 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
PKD2Q13563 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
PKD2Q13563 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
PKD2Q13563 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
PKD2Q13563 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
PKD2Q13563 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
PKD2Q13563 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
PKD2Q13563 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
PKD2Q13563 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
PKD2Q13563 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC32.31■■■□□ 2.76
PKD2Q13563 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
PKD2Q13563 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
PKD2Q13563 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
PKD2Q13563 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
PKD2Q13563 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
PKD2Q13563 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
PKD2Q13563 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
PKD2Q13563 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
PKD2Q13563 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
PKD2Q13563 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
PKD2Q13563 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
PKD2Q13563 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
PKD2Q13563 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
PKD2Q13563 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
PKD2Q13563 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
PKD2Q13563 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
PKD2Q13563 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
PKD2Q13563 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
PKD2Q13563 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
PKD2Q13563 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
PKD2Q13563 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
PKD2Q13563 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
PKD2Q13563 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
PKD2Q13563 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
PKD2Q13563 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
PKD2Q13563 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
PKD2Q13563 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
PKD2Q13563 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
PKD2Q13563 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
PKD2Q13563 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC32.28■■■□□ 2.76
PKD2Q13563 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
PKD2Q13563 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
PKD2Q13563 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
PKD2Q13563 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
PKD2Q13563 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
PKD2Q13563 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
PKD2Q13563 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
PKD2Q13563 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
PKD2Q13563 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
PKD2Q13563 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC32.27■■■□□ 2.76
PKD2Q13563 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
PKD2Q13563 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC32.26■■■□□ 2.76
PKD2Q13563 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
PKD2Q13563 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
PKD2Q13563 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
PKD2Q13563 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
PKD2Q13563 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
PKD2Q13563 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
PKD2Q13563 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
PKD2Q13563 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
PKD2Q13563 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
PKD2Q13563 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
PKD2Q13563 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
PKD2Q13563 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
PKD2Q13563 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
PKD2Q13563 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
PKD2Q13563 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
PKD2Q13563 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
PKD2Q13563 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
PKD2Q13563 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
PKD2Q13563 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
PKD2Q13563 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
PKD2Q13563 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
PKD2Q13563 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
PKD2Q13563 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
PKD2Q13563 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
PKD2Q13563 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
PKD2Q13563 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
PKD2Q13563 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
PKD2Q13563 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
PKD2Q13563 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
PKD2Q13563 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
PKD2Q13563 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
PKD2Q13563 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
PKD2Q13563 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
PKD2Q13563 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
PKD2Q13563 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
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