Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C1orf61Q13536 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C1orf61Q13536 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C1orf61Q13536 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
C1orf61Q13536 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C1orf61Q13536 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
C1orf61Q13536 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
C1orf61Q13536 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
C1orf61Q13536 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C1orf61Q13536 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
C1orf61Q13536 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.3■■□□□ 1
C1orf61Q13536 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
C1orf61Q13536 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
C1orf61Q13536 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C1orf61Q13536 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C1orf61Q13536 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C1orf61Q13536 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C1orf61Q13536 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C1orf61Q13536 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C1orf61Q13536 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C1orf61Q13536 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C1orf61Q13536 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C1orf61Q13536 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
C1orf61Q13536 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
C1orf61Q13536 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
C1orf61Q13536 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
C1orf61Q13536 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
C1orf61Q13536 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
C1orf61Q13536 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
C1orf61Q13536 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C1orf61Q13536 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
C1orf61Q13536 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C1orf61Q13536 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C1orf61Q13536 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C1orf61Q13536 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C1orf61Q13536 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C1orf61Q13536 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
C1orf61Q13536 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
C1orf61Q13536 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
C1orf61Q13536 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
C1orf61Q13536 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C1orf61Q13536 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
C1orf61Q13536 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
C1orf61Q13536 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
C1orf61Q13536 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C1orf61Q13536 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C1orf61Q13536 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C1orf61Q13536 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C1orf61Q13536 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C1orf61Q13536 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
C1orf61Q13536 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C1orf61Q13536 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
C1orf61Q13536 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C1orf61Q13536 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
C1orf61Q13536 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
C1orf61Q13536 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
C1orf61Q13536 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C1orf61Q13536 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
C1orf61Q13536 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
C1orf61Q13536 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C1orf61Q13536 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C1orf61Q13536 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C1orf61Q13536 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C1orf61Q13536 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
C1orf61Q13536 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C1orf61Q13536 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C1orf61Q13536 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C1orf61Q13536 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
C1orf61Q13536 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C1orf61Q13536 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C1orf61Q13536 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C1orf61Q13536 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C1orf61Q13536 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C1orf61Q13536 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C1orf61Q13536 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C1orf61Q13536 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C1orf61Q13536 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C1orf61Q13536 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C1orf61Q13536 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C1orf61Q13536 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
C1orf61Q13536 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C1orf61Q13536 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C1orf61Q13536 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C1orf61Q13536 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C1orf61Q13536 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C1orf61Q13536 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C1orf61Q13536 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C1orf61Q13536 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C1orf61Q13536 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C1orf61Q13536 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C1orf61Q13536 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
C1orf61Q13536 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C1orf61Q13536 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C1orf61Q13536 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C1orf61Q13536 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C1orf61Q13536 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C1orf61Q13536 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C1orf61Q13536 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C1orf61Q13536 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C1orf61Q13536 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
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