Protein–RNA interactions for Protein: Q13491

GPM6B, Neuronal membrane glycoprotein M6-b, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPM6BQ13491 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
GPM6BQ13491 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GPM6BQ13491 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GPM6BQ13491 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GPM6BQ13491 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GPM6BQ13491 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GPM6BQ13491 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GPM6BQ13491 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GPM6BQ13491 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GPM6BQ13491 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
GPM6BQ13491 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GPM6BQ13491 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GPM6BQ13491 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GPM6BQ13491 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GPM6BQ13491 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GPM6BQ13491 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GPM6BQ13491 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GPM6BQ13491 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
GPM6BQ13491 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPM6BQ13491 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPM6BQ13491 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPM6BQ13491 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPM6BQ13491 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPM6BQ13491 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPM6BQ13491 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
GPM6BQ13491 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPM6BQ13491 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPM6BQ13491 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPM6BQ13491 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPM6BQ13491 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPM6BQ13491 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPM6BQ13491 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GPM6BQ13491 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GPM6BQ13491 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GPM6BQ13491 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GPM6BQ13491 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GPM6BQ13491 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GPM6BQ13491 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GPM6BQ13491 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GPM6BQ13491 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GPM6BQ13491 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GPM6BQ13491 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GPM6BQ13491 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GPM6BQ13491 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GPM6BQ13491 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GPM6BQ13491 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GPM6BQ13491 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GPM6BQ13491 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GPM6BQ13491 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GPM6BQ13491 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GPM6BQ13491 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GPM6BQ13491 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GPM6BQ13491 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GPM6BQ13491 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GPM6BQ13491 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GPM6BQ13491 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GPM6BQ13491 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
GPM6BQ13491 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
GPM6BQ13491 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GPM6BQ13491 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GPM6BQ13491 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GPM6BQ13491 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GPM6BQ13491 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPM6BQ13491 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPM6BQ13491 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPM6BQ13491 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPM6BQ13491 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPM6BQ13491 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPM6BQ13491 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPM6BQ13491 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPM6BQ13491 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPM6BQ13491 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
GPM6BQ13491 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPM6BQ13491 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPM6BQ13491 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPM6BQ13491 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPM6BQ13491 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPM6BQ13491 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPM6BQ13491 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPM6BQ13491 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GPM6BQ13491 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GPM6BQ13491 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GPM6BQ13491 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GPM6BQ13491 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GPM6BQ13491 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GPM6BQ13491 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GPM6BQ13491 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GPM6BQ13491 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GPM6BQ13491 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPM6BQ13491 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPM6BQ13491 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPM6BQ13491 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GPM6BQ13491 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPM6BQ13491 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPM6BQ13491 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GPM6BQ13491 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPM6BQ13491 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPM6BQ13491 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPM6BQ13491 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPM6BQ13491 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
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