Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PMS2P3Q13401 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PMS2P3Q13401 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PMS2P3Q13401 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PMS2P3Q13401 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PMS2P3Q13401 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PMS2P3Q13401 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PMS2P3Q13401 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PMS2P3Q13401 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PMS2P3Q13401 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PMS2P3Q13401 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PMS2P3Q13401 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PMS2P3Q13401 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PMS2P3Q13401 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PMS2P3Q13401 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PMS2P3Q13401 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PMS2P3Q13401 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PMS2P3Q13401 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PMS2P3Q13401 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PMS2P3Q13401 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PMS2P3Q13401 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PMS2P3Q13401 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PMS2P3Q13401 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PMS2P3Q13401 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PMS2P3Q13401 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PMS2P3Q13401 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PMS2P3Q13401 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PMS2P3Q13401 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PMS2P3Q13401 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PMS2P3Q13401 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PMS2P3Q13401 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PMS2P3Q13401 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PMS2P3Q13401 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PMS2P3Q13401 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PMS2P3Q13401 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PMS2P3Q13401 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PMS2P3Q13401 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PMS2P3Q13401 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PMS2P3Q13401 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PMS2P3Q13401 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PMS2P3Q13401 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PMS2P3Q13401 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PMS2P3Q13401 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PMS2P3Q13401 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PMS2P3Q13401 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PMS2P3Q13401 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PMS2P3Q13401 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PMS2P3Q13401 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PMS2P3Q13401 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PMS2P3Q13401 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PMS2P3Q13401 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PMS2P3Q13401 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PMS2P3Q13401 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PMS2P3Q13401 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PMS2P3Q13401 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PMS2P3Q13401 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PMS2P3Q13401 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PMS2P3Q13401 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PMS2P3Q13401 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PMS2P3Q13401 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PMS2P3Q13401 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PMS2P3Q13401 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PMS2P3Q13401 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PMS2P3Q13401 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PMS2P3Q13401 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PMS2P3Q13401 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PMS2P3Q13401 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PMS2P3Q13401 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PMS2P3Q13401 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PMS2P3Q13401 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PMS2P3Q13401 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PMS2P3Q13401 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PMS2P3Q13401 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PMS2P3Q13401 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PMS2P3Q13401 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PMS2P3Q13401 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PMS2P3Q13401 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PMS2P3Q13401 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PMS2P3Q13401 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PMS2P3Q13401 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PMS2P3Q13401 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PMS2P3Q13401 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PMS2P3Q13401 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PMS2P3Q13401 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PMS2P3Q13401 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PMS2P3Q13401 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PMS2P3Q13401 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PMS2P3Q13401 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PMS2P3Q13401 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PMS2P3Q13401 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PMS2P3Q13401 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PMS2P3Q13401 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PMS2P3Q13401 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PMS2P3Q13401 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PMS2P3Q13401 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PMS2P3Q13401 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PMS2P3Q13401 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PMS2P3Q13401 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PMS2P3Q13401 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PMS2P3Q13401 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
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