Protein–RNA interactions for Protein: Q13330

MTA1, Metastasis-associated protein MTA1, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTA1Q13330 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MTA1Q13330 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MTA1Q13330 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MTA1Q13330 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MTA1Q13330 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MTA1Q13330 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MTA1Q13330 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MTA1Q13330 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MTA1Q13330 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MTA1Q13330 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MTA1Q13330 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MTA1Q13330 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MTA1Q13330 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MTA1Q13330 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MTA1Q13330 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MTA1Q13330 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MTA1Q13330 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MTA1Q13330 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MTA1Q13330 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MTA1Q13330 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MTA1Q13330 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MTA1Q13330 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MTA1Q13330 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MTA1Q13330 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MTA1Q13330 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MTA1Q13330 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MTA1Q13330 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MTA1Q13330 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MTA1Q13330 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MTA1Q13330 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MTA1Q13330 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MTA1Q13330 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MTA1Q13330 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MTA1Q13330 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MTA1Q13330 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MTA1Q13330 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MTA1Q13330 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MTA1Q13330 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MTA1Q13330 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MTA1Q13330 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MTA1Q13330 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MTA1Q13330 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MTA1Q13330 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MTA1Q13330 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MTA1Q13330 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MTA1Q13330 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MTA1Q13330 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MTA1Q13330 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MTA1Q13330 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MTA1Q13330 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MTA1Q13330 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
MTA1Q13330 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MTA1Q13330 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MTA1Q13330 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MTA1Q13330 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MTA1Q13330 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MTA1Q13330 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MTA1Q13330 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MTA1Q13330 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MTA1Q13330 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MTA1Q13330 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MTA1Q13330 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
MTA1Q13330 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MTA1Q13330 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MTA1Q13330 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MTA1Q13330 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MTA1Q13330 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MTA1Q13330 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MTA1Q13330 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MTA1Q13330 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MTA1Q13330 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MTA1Q13330 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MTA1Q13330 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MTA1Q13330 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MTA1Q13330 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MTA1Q13330 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MTA1Q13330 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MTA1Q13330 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MTA1Q13330 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MTA1Q13330 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MTA1Q13330 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MTA1Q13330 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MTA1Q13330 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MTA1Q13330 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MTA1Q13330 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MTA1Q13330 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MTA1Q13330 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MTA1Q13330 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MTA1Q13330 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MTA1Q13330 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MTA1Q13330 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MTA1Q13330 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MTA1Q13330 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MTA1Q13330 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MTA1Q13330 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MTA1Q13330 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MTA1Q13330 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MTA1Q13330 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MTA1Q13330 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MTA1Q13330 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms