Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SGCGQ13326 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SGCGQ13326 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SGCGQ13326 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SGCGQ13326 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SGCGQ13326 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SGCGQ13326 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SGCGQ13326 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SGCGQ13326 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SGCGQ13326 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SGCGQ13326 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SGCGQ13326 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SGCGQ13326 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SGCGQ13326 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SGCGQ13326 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SGCGQ13326 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SGCGQ13326 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SGCGQ13326 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SGCGQ13326 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SGCGQ13326 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SGCGQ13326 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SGCGQ13326 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SGCGQ13326 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SGCGQ13326 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SGCGQ13326 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SGCGQ13326 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SGCGQ13326 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SGCGQ13326 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SGCGQ13326 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SGCGQ13326 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SGCGQ13326 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SGCGQ13326 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SGCGQ13326 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SGCGQ13326 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SGCGQ13326 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SGCGQ13326 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SGCGQ13326 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SGCGQ13326 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SGCGQ13326 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SGCGQ13326 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SGCGQ13326 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SGCGQ13326 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SGCGQ13326 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SGCGQ13326 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SGCGQ13326 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SGCGQ13326 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SGCGQ13326 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SGCGQ13326 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SGCGQ13326 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SGCGQ13326 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SGCGQ13326 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SGCGQ13326 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SGCGQ13326 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SGCGQ13326 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SGCGQ13326 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SGCGQ13326 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SGCGQ13326 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SGCGQ13326 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SGCGQ13326 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SGCGQ13326 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SGCGQ13326 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SGCGQ13326 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SGCGQ13326 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SGCGQ13326 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SGCGQ13326 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SGCGQ13326 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SGCGQ13326 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SGCGQ13326 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SGCGQ13326 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SGCGQ13326 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SGCGQ13326 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SGCGQ13326 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SGCGQ13326 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SGCGQ13326 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SGCGQ13326 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SGCGQ13326 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SGCGQ13326 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SGCGQ13326 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SGCGQ13326 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SGCGQ13326 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SGCGQ13326 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SGCGQ13326 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SGCGQ13326 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SGCGQ13326 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SGCGQ13326 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SGCGQ13326 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SGCGQ13326 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SGCGQ13326 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SGCGQ13326 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SGCGQ13326 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SGCGQ13326 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SGCGQ13326 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SGCGQ13326 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SGCGQ13326 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SGCGQ13326 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SGCGQ13326 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SGCGQ13326 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SGCGQ13326 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SGCGQ13326 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SGCGQ13326 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
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