Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATMQ13315 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATMQ13315 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATMQ13315 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATMQ13315 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ATMQ13315 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATMQ13315 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ATMQ13315 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATMQ13315 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATMQ13315 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATMQ13315 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATMQ13315 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATMQ13315 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ATMQ13315 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATMQ13315 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATMQ13315 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATMQ13315 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATMQ13315 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATMQ13315 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATMQ13315 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATMQ13315 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATMQ13315 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATMQ13315 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATMQ13315 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATMQ13315 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ATMQ13315 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATMQ13315 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATMQ13315 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATMQ13315 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATMQ13315 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATMQ13315 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATMQ13315 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATMQ13315 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ATMQ13315 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATMQ13315 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATMQ13315 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATMQ13315 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATMQ13315 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATMQ13315 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATMQ13315 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATMQ13315 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATMQ13315 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATMQ13315 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATMQ13315 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
ATMQ13315 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATMQ13315 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATMQ13315 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATMQ13315 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATMQ13315 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATMQ13315 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATMQ13315 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATMQ13315 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATMQ13315 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATMQ13315 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ATMQ13315 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATMQ13315 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATMQ13315 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATMQ13315 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATMQ13315 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATMQ13315 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATMQ13315 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATMQ13315 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATMQ13315 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATMQ13315 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATMQ13315 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATMQ13315 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ATMQ13315 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATMQ13315 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATMQ13315 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATMQ13315 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATMQ13315 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATMQ13315 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ATMQ13315 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ATMQ13315 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ATMQ13315 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATMQ13315 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATMQ13315 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATMQ13315 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATMQ13315 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATMQ13315 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATMQ13315 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATMQ13315 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATMQ13315 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATMQ13315 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATMQ13315 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATMQ13315 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATMQ13315 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATMQ13315 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATMQ13315 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATMQ13315 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATMQ13315 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATMQ13315 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATMQ13315 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATMQ13315 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATMQ13315 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATMQ13315 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATMQ13315 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATMQ13315 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
ATMQ13315 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATMQ13315 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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