Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFT88Q13099 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFT88Q13099 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFT88Q13099 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFT88Q13099 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFT88Q13099 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFT88Q13099 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFT88Q13099 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFT88Q13099 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFT88Q13099 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFT88Q13099 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFT88Q13099 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFT88Q13099 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFT88Q13099 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IFT88Q13099 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IFT88Q13099 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22■■□□□ 1.11
IFT88Q13099 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22■■□□□ 1.11
IFT88Q13099 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
IFT88Q13099 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
IFT88Q13099 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IFT88Q13099 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
IFT88Q13099 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
IFT88Q13099 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IFT88Q13099 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
IFT88Q13099 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
IFT88Q13099 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IFT88Q13099 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IFT88Q13099 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IFT88Q13099 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IFT88Q13099 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IFT88Q13099 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IFT88Q13099 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IFT88Q13099 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IFT88Q13099 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IFT88Q13099 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IFT88Q13099 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IFT88Q13099 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IFT88Q13099 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IFT88Q13099 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IFT88Q13099 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
IFT88Q13099 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IFT88Q13099 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IFT88Q13099 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IFT88Q13099 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IFT88Q13099 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IFT88Q13099 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IFT88Q13099 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IFT88Q13099 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
IFT88Q13099 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
IFT88Q13099 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
IFT88Q13099 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IFT88Q13099 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
IFT88Q13099 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
IFT88Q13099 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IFT88Q13099 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IFT88Q13099 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IFT88Q13099 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IFT88Q13099 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IFT88Q13099 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IFT88Q13099 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IFT88Q13099 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IFT88Q13099 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IFT88Q13099 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IFT88Q13099 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IFT88Q13099 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IFT88Q13099 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IFT88Q13099 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IFT88Q13099 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IFT88Q13099 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IFT88Q13099 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IFT88Q13099 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IFT88Q13099 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IFT88Q13099 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IFT88Q13099 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
IFT88Q13099 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
IFT88Q13099 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
IFT88Q13099 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IFT88Q13099 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
IFT88Q13099 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
IFT88Q13099 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
IFT88Q13099 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
IFT88Q13099 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
IFT88Q13099 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IFT88Q13099 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IFT88Q13099 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IFT88Q13099 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IFT88Q13099 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IFT88Q13099 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IFT88Q13099 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IFT88Q13099 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
IFT88Q13099 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
IFT88Q13099 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IFT88Q13099 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IFT88Q13099 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
IFT88Q13099 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
IFT88Q13099 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IFT88Q13099 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IFT88Q13099 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IFT88Q13099 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
IFT88Q13099 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms