Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
TROQ12816 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
TROQ12816 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
TROQ12816 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
TROQ12816 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
TROQ12816 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
TROQ12816 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
TROQ12816 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
TROQ12816 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
TROQ12816 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
TROQ12816 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
TROQ12816 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
TROQ12816 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
TROQ12816 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
TROQ12816 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
TROQ12816 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
TROQ12816 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
TROQ12816 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
TROQ12816 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC33.74■■■□□ 2.99
TROQ12816 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
TROQ12816 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
TROQ12816 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
TROQ12816 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
TROQ12816 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
TROQ12816 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
TROQ12816 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
TROQ12816 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
TROQ12816 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
TROQ12816 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
TROQ12816 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
TROQ12816 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
TROQ12816 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
TROQ12816 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
TROQ12816 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
TROQ12816 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
TROQ12816 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
TROQ12816 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
TROQ12816 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
TROQ12816 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
TROQ12816 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
TROQ12816 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
TROQ12816 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
TROQ12816 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
TROQ12816 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
TROQ12816 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
TROQ12816 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
TROQ12816 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
TROQ12816 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
TROQ12816 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
TROQ12816 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
TROQ12816 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
TROQ12816 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
TROQ12816 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
TROQ12816 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
TROQ12816 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
TROQ12816 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
TROQ12816 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
TROQ12816 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
TROQ12816 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
TROQ12816 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
TROQ12816 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
TROQ12816 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
TROQ12816 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
TROQ12816 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
TROQ12816 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
TROQ12816 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
TROQ12816 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.98
TROQ12816 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
TROQ12816 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.98
TROQ12816 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
TROQ12816 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
TROQ12816 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
TROQ12816 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
TROQ12816 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
TROQ12816 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
TROQ12816 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
TROQ12816 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
TROQ12816 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
TROQ12816 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
TROQ12816 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
TROQ12816 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
TROQ12816 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
TROQ12816 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
TROQ12816 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
TROQ12816 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC33.68■■■□□ 2.98
TROQ12816 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC33.68■■■□□ 2.98
TROQ12816 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
TROQ12816 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
TROQ12816 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
TROQ12816 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
TROQ12816 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
TROQ12816 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
TROQ12816 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
TROQ12816 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
TROQ12816 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
TROQ12816 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
TROQ12816 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
TROQ12816 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
TROQ12816 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
TROQ12816 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
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