Protein–RNA interactions for Protein: Q12309

CLF1, Pre-mRNA-splicing factor CLF1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 687 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CLF1Q12309 YAL069WYAL069W 315 nt4.89□□□□□ -1.63
CLF1Q12309 TAF12YDR145W 1620 nt4.89□□□□□ -1.63
CLF1Q12309 BOI2YER114C 3123 nt4.88□□□□□ -1.63
CLF1Q12309 HMG1YML075C 3165 nt4.88□□□□□ -1.63
CLF1Q12309 OPT2YPR194C 2634 nt4.88□□□□□ -1.63
CLF1Q12309 CTH1YDR151C 978 nt4.88□□□□□ -1.63
CLF1Q12309 SAE3YHR079C-A 276 nt4.88□□□□□ -1.63
CLF1Q12309 RPS4BYHR203C 786 nt4.88□□□□□ -1.63
CLF1Q12309 GPP1YIL053W 753 nt4.88□□□□□ -1.63
CLF1Q12309 RPS4AYJR145C 786 nt4.88□□□□□ -1.63
CLF1Q12309 BOS1YLR078C 735 nt4.88□□□□□ -1.63
CLF1Q12309 SEC72YLR292C 582 nt4.88□□□□□ -1.63
CLF1Q12309 FYV6YNL133C 522 nt4.88□□□□□ -1.63
CLF1Q12309 TMA16YOR252W 537 nt4.88□□□□□ -1.63
CLF1Q12309 LOA1YPR139C 903 nt4.88□□□□□ -1.63
CLF1Q12309 CNS1YBR155W 1158 nt4.88□□□□□ -1.63
CLF1Q12309 LDH1YBR204C 1128 nt4.88□□□□□ -1.63
CLF1Q12309 SAT4YCR008W 1812 nt4.88□□□□□ -1.63
CLF1Q12309 RTK1YDL025C 1863 nt4.88□□□□□ -1.63
CLF1Q12309 YIL001WYIL001W 1542 nt4.87□□□□□ -1.63
CLF1Q12309 EAR1YMR171C 1653 nt4.87□□□□□ -1.63
CLF1Q12309 UBP8YMR223W 1416 nt4.87□□□□□ -1.63
CLF1Q12309 JHD2YJR119C 2187 nt4.87□□□□□ -1.63
CLF1Q12309 IMD2YHR216W 1572 nt4.87□□□□□ -1.63
CLF1Q12309 RDH54YBR073W 2877 nt4.86□□□□□ -1.63
CLF1Q12309 PER1YCR044C 1074 nt4.86□□□□□ -1.63
CLF1Q12309 BCP1YDR361C 852 nt4.86□□□□□ -1.63
CLF1Q12309 VMA7YGR020C 357 nt4.86□□□□□ -1.63
CLF1Q12309 HTD2YHR067W 843 nt4.86□□□□□ -1.63
CLF1Q12309 YKL177WYKL177W 339 nt4.86□□□□□ -1.63
CLF1Q12309 RRG9YNL213C 645 nt4.86□□□□□ -1.63
CLF1Q12309 POP3YNL282W 588 nt4.86□□□□□ -1.63
CLF1Q12309 TPT1YOL102C 693 nt4.86□□□□□ -1.63
CLF1Q12309 VPS21YOR089C 633 nt4.86□□□□□ -1.63
CLF1Q12309 PLP2YOR281C 861 nt4.86□□□□□ -1.63
CLF1Q12309 YBR116CYBR116C 528 nt4.86□□□□□ -1.63
CLF1Q12309 NUP2YLR335W 2163 nt4.86□□□□□ -1.63
CLF1Q12309 COM2YER130C 1332 nt4.86□□□□□ -1.63
CLF1Q12309 ESC2YDR363W 1371 nt4.86□□□□□ -1.63
CLF1Q12309 SER3YER081W 1410 nt4.86□□□□□ -1.63
CLF1Q12309 SPC105YGL093W 2754 nt4.86□□□□□ -1.63
CLF1Q12309 SPO1YNL012W 1896 nt4.86□□□□□ -1.63
CLF1Q12309 ADP1YCR011C 3150 nt4.86□□□□□ -1.63
CLF1Q12309 GLN4YOR168W 2430 nt4.85□□□□□ -1.63
CLF1Q12309 YDR056CYDR056C 618 nt4.85□□□□□ -1.63
CLF1Q12309 YFR045WYFR045W 930 nt4.85□□□□□ -1.63
CLF1Q12309 YAE1YJR067C 426 nt4.85□□□□□ -1.63
CLF1Q12309 YLL037WYLL037W 381 nt4.85□□□□□ -1.63
CLF1Q12309 YLR339CYLR339C 552 nt4.85□□□□□ -1.63
CLF1Q12309 RCM1YNL022C 1473 nt4.85□□□□□ -1.63
CLF1Q12309 NAM9YNL137C 1461 nt4.85□□□□□ -1.63
CLF1Q12309 RRN11YML043C 1524 nt4.85□□□□□ -1.63
CLF1Q12309 HCM1YCR065W 1695 nt4.85□□□□□ -1.63
CLF1Q12309 THS1YIL078W 2205 nt4.85□□□□□ -1.63
CLF1Q12309 STV1YMR054W 2673 nt4.85□□□□□ -1.63
CLF1Q12309 HOS3YPL116W 2094 nt4.84□□□□□ -1.63
CLF1Q12309 YTM1YOR272W 1383 nt4.84□□□□□ -1.63
CLF1Q12309 YDL162CYDL162C 357 nt4.84□□□□□ -1.63
CLF1Q12309 RCN1YKL159C 636 nt4.84□□□□□ -1.63
CLF1Q12309 YLR407WYLR407W 687 nt4.84□□□□□ -1.63
CLF1Q12309 SUB1YMR039C 879 nt4.84□□□□□ -1.63
CLF1Q12309 SRT1YMR101C 1032 nt4.84□□□□□ -1.63
CLF1Q12309 RNA1YMR235C 1224 nt4.84□□□□□ -1.63
CLF1Q12309 TEL1YBL088C 8364 nt4.84□□□□□ -1.64
CLF1Q12309 ATP16YDL004W 483 nt4.83□□□□□ -1.64
CLF1Q12309 TYS1YGR185C 1185 nt4.83□□□□□ -1.64
CLF1Q12309 MNN11YJL183W 1269 nt4.83□□□□□ -1.64
CLF1Q12309 TDA5YLR426W 981 nt4.83□□□□□ -1.64
CLF1Q12309 YML031C-AYML031C-A 336 nt4.83□□□□□ -1.64
CLF1Q12309 MRPS17YMR188C 714 nt4.83□□□□□ -1.64
CLF1Q12309 YOR152CYOR152C 771 nt4.83□□□□□ -1.64
CLF1Q12309 MGE1YOR232W 687 nt4.83□□□□□ -1.64
CLF1Q12309 MSK1YNL073W 1731 nt4.83□□□□□ -1.64
CLF1Q12309 SRS2YJL092W 3525 nt4.83□□□□□ -1.64
CLF1Q12309 TRM11YOL124C 1302 nt4.82□□□□□ -1.64
CLF1Q12309 API2YDR525W 330 nt4.82□□□□□ -1.64
CLF1Q12309 PEX21YGR239C 867 nt4.82□□□□□ -1.64
CLF1Q12309 YMR181CYMR181C 465 nt4.82□□□□□ -1.64
CLF1Q12309 IRC13YOR235W 315 nt4.82□□□□□ -1.64
CLF1Q12309 snR44snR44 211 nt4.82□□□□□ -1.64
CLF1Q12309 NUP133YKR082W 3474 nt4.82□□□□□ -1.64
CLF1Q12309 BCH2YKR027W 2298 nt4.81□□□□□ -1.64
CLF1Q12309 BCK2YER167W 2556 nt4.81□□□□□ -1.64
CLF1Q12309 FAA1YOR317W 2103 nt4.81□□□□□ -1.64
CLF1Q12309 RPL22BYFL034C-A 369 nt4.81□□□□□ -1.64
CLF1Q12309 RTA1YGR213C 954 nt4.81□□□□□ -1.64
CLF1Q12309 EFB1YAL003W 621 nt4.81□□□□□ -1.64
CLF1Q12309 YKL123WYKL123W 381 nt4.81□□□□□ -1.64
CLF1Q12309 GCD7YLR291C 1146 nt4.81□□□□□ -1.64
CLF1Q12309 FBP1YLR377C 1047 nt4.81□□□□□ -1.64
CLF1Q12309 WRS1YOL097C 1299 nt4.81□□□□□ -1.64
CLF1Q12309 YOL106WYOL106W 354 nt4.81□□□□□ -1.64
CLF1Q12309 YOR314WYOR314W 330 nt4.81□□□□□ -1.64
CLF1Q12309 YBR056W-AYBR056W-A 201 nt4.81□□□□□ -1.64
CLF1Q12309 DIM1YPL266W 957 nt4.81□□□□□ -1.64
CLF1Q12309 ALE1YOR175C 1860 nt4.81□□□□□ -1.64
CLF1Q12309 CYM1YDR430C 2970 nt4.8□□□□□ -1.64
CLF1Q12309 YCR101CYCR101C 549 nt4.8□□□□□ -1.64
CLF1Q12309 TMA17YDL110C 453 nt4.8□□□□□ -1.64
CLF1Q12309 SPT15YER148W 723 nt4.8□□□□□ -1.64
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