Protein–RNA interactions for Protein: Q12260

TY2A-B, Transposon Ty2-B Gag polyprotein, yeast

Predictions only

Length 438 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TY2A-B	Q12260	MTR2	YKL186C	555 nt		4.19	□□□□□ -1.74
TY2A-B	Q12260	IRC25	YLR021W	540 nt		4.19	□□□□□ -1.74
TY2A-B	Q12260	YIM1	YMR152W	1098 nt		4.19	□□□□□ -1.74
TY2A-B	Q12260	DUG3	YNL191W	1074 nt		4.19	□□□□□ -1.74
TY2A-B	Q12260	MER1	YNL210W	813 nt		4.19	□□□□□ -1.74
TY2A-B	Q12260	MCM16	YPR046W	546 nt		4.19	□□□□□ -1.74
TY2A-B	Q12260	GSY1	YFR015C	2127 nt		4.19	□□□□□ -1.74
TY2A-B	Q12260	YNR066C	YNR066C	1311 nt		4.19	□□□□□ -1.74
TY2A-B	Q12260	CEG1	YGL130W	1380 nt		4.18	□□□□□ -1.74
TY2A-B	Q12260	PER1	YCR044C	1074 nt		4.18	□□□□□ -1.74
TY2A-B	Q12260	SNU23	YDL098C	585 nt		4.18	□□□□□ -1.74
TY2A-B	Q12260	UBC8	YEL012W	657 nt		4.18	□□□□□ -1.74
TY2A-B	Q12260	KXD1	YGL079W	657 nt		4.18	□□□□□ -1.74
TY2A-B	Q12260	Q0144	Q0144	330 nt		4.18	□□□□□ -1.74
TY2A-B	Q12260	YPT35	YHR105W	645 nt		4.18	□□□□□ -1.74
TY2A-B	Q12260	YLR156W	YLR156W	345 nt		4.18	□□□□□ -1.74
TY2A-B	Q12260	YLR157W-D	YLR157W-D	213 nt		4.18	□□□□□ -1.74
TY2A-B	Q12260	YLR159W	YLR159W	345 nt		4.18	□□□□□ -1.74
TY2A-B	Q12260	YLR161W	YLR161W	345 nt		4.18	□□□□□ -1.74
TY2A-B	Q12260	FBP1	YLR377C	1047 nt		4.18	□□□□□ -1.74
TY2A-B	Q12260	SPC2	YML055W	537 nt		4.18	□□□□□ -1.74
TY2A-B	Q12260	IPP1	YBR011C	864 nt		4.18	□□□□□ -1.74
TY2A-B	Q12260	ARC40	YBR234C	1155 nt		4.18	□□□□□ -1.74
TY2A-B	Q12260	DPH6	YLR143W	2058 nt		4.18	□□□□□ -1.74
TY2A-B	Q12260	IMD2	YHR216W	1572 nt		4.18	□□□□□ -1.74
TY2A-B	Q12260	YER077C	YER077C	2067 nt		4.17	□□□□□ -1.74
TY2A-B	Q12260	YMR221C	YMR221C	1515 nt		4.17	□□□□□ -1.74
TY2A-B	Q12260	SFI1	YLL003W	2841 nt		4.17	□□□□□ -1.74
TY2A-B	Q12260	CBS2	YDR197W	1170 nt		4.17	□□□□□ -1.74
TY2A-B	Q12260	TFB3	YDR460W	966 nt		4.17	□□□□□ -1.74
TY2A-B	Q12260	RPL24B	YGR148C	468 nt		4.17	□□□□□ -1.74
TY2A-B	Q12260	RFA3	YJL173C	369 nt		4.17	□□□□□ -1.74
TY2A-B	Q12260	TVP38	YKR088C	1014 nt		4.17	□□□□□ -1.74
TY2A-B	Q12260	YBL029C-A	YBL029C-A	285 nt		4.17	□□□□□ -1.74
TY2A-B	Q12260	RPB8	YOR224C	441 nt		4.17	□□□□□ -1.74
TY2A-B	Q12260	TYE7	YOR344C	876 nt		4.17	□□□□□ -1.74
TY2A-B	Q12260	ICY2	YPL250C	411 nt		4.17	□□□□□ -1.74
TY2A-B	Q12260	DSL1	YNL258C	2265 nt		4.17	□□□□□ -1.74
TY2A-B	Q12260	MSN4	YKL062W	1893 nt		4.17	□□□□□ -1.74
TY2A-B	Q12260	PAH1	YMR165C	2589 nt		4.16	□□□□□ -1.74
TY2A-B	Q12260	NHP10	YDL002C	612 nt		4.16	□□□□□ -1.74
TY2A-B	Q12260	RCR2	YDR003W	633 nt		4.16	□□□□□ -1.74
TY2A-B	Q12260	TAF10	YDR167W	621 nt		4.16	□□□□□ -1.74
TY2A-B	Q12260	YGL138C	YGL138C	1038 nt		4.16	□□□□□ -1.74
TY2A-B	Q12260	YGL230C	YGL230C	444 nt		4.16	□□□□□ -1.74
TY2A-B	Q12260	YKR070W	YKR070W	1059 nt		4.16	□□□□□ -1.74
TY2A-B	Q12260	HPA2	YPR193C	471 nt		4.16	□□□□□ -1.74
TY2A-B	Q12260	REI1	YBR267W	1182 nt		4.16	□□□□□ -1.74
TY2A-B	Q12260	MET17	YLR303W	1335 nt		4.16	□□□□□ -1.74
TY2A-B	Q12260	HOM3	YER052C	1584 nt		4.15	□□□□□ -1.74
TY2A-B	Q12260	MET12	YPL023C	1974 nt		4.15	□□□□□ -1.74
TY2A-B	Q12260	YFR057W	YFR057W	456 nt		4.15	□□□□□ -1.75
TY2A-B	Q12260	AIR1	YIL079C	1083 nt		4.15	□□□□□ -1.75
TY2A-B	Q12260	YNK1	YKL067W	462 nt		4.15	□□□□□ -1.75
TY2A-B	Q12260	AHP1	YLR109W	531 nt		4.15	□□□□□ -1.75
TY2A-B	Q12260	CAF20	YOR276W	486 nt		4.15	□□□□□ -1.75
TY2A-B	Q12260	RPS11B	YBR048W	471 nt		4.15	□□□□□ -1.75
TY2A-B	Q12260	TPD3	YAL016W	1908 nt		4.15	□□□□□ -1.75
TY2A-B	Q12260	MET4	YNL103W	2019 nt		4.14	□□□□□ -1.75
TY2A-B	Q12260	AEP3	YPL005W	1821 nt		4.14	□□□□□ -1.75
TY2A-B	Q12260	SLI1	YGR212W	1407 nt		4.14	□□□□□ -1.75
TY2A-B	Q12260	VPS27	YNR006W	1869 nt		4.14	□□□□□ -1.75
TY2A-B	Q12260	ROK1	YGL171W	1695 nt		4.14	□□□□□ -1.75
TY2A-B	Q12260	YIL021C-A	YIL021C-A	270 nt		4.14	□□□□□ -1.75
TY2A-B	Q12260	FMP33	YJL161W	543 nt		4.14	□□□□□ -1.75
TY2A-B	Q12260	YJR012C	YJR012C	624 nt		4.14	□□□□□ -1.75
TY2A-B	Q12260	ACP1	YKL192C	378 nt		4.14	□□□□□ -1.75
TY2A-B	Q12260	NKP2	YLR315W	462 nt		4.14	□□□□□ -1.75
TY2A-B	Q12260	YLR364C-A	YLR364C-A	123 nt		4.14	□□□□□ -1.75
TY2A-B	Q12260	SAM37	YMR060C	984 nt		4.14	□□□□□ -1.75
TY2A-B	Q12260	YOL106W	YOL106W	354 nt		4.14	□□□□□ -1.75
TY2A-B	Q12260	PFK27	YOL136C	1194 nt		4.14	□□□□□ -1.75
TY2A-B	Q12260	YPL278C	YPL278C	303 nt		4.14	□□□□□ -1.75
TY2A-B	Q12260	YPR027C	YPR027C	834 nt		4.14	□□□□□ -1.75
TY2A-B	Q12260	MRPL51	YPR100W	423 nt		4.14	□□□□□ -1.75
TY2A-B	Q12260	FAR10	YLR238W	1437 nt		4.13	□□□□□ -1.75
TY2A-B	Q12260	PDR5	YOR153W	4536 nt		4.13	□□□□□ -1.75
TY2A-B	Q12260	CYM1	YDR430C	2970 nt		4.13	□□□□□ -1.75
TY2A-B	Q12260	MDM30	YLR368W	1797 nt		4.13	□□□□□ -1.75
TY2A-B	Q12260	IZH1	YDR492W	951 nt		4.13	□□□□□ -1.75
TY2A-B	Q12260	YHL049C	YHL049C	816 nt		4.13	□□□□□ -1.75
TY2A-B	Q12260	MNN11	YJL183W	1269 nt		4.13	□□□□□ -1.75
TY2A-B	Q12260	OAR1	YKL055C	837 nt		4.13	□□□□□ -1.75
TY2A-B	Q12260	MSE1	YOL033W	1611 nt		4.13	□□□□□ -1.75
TY2A-B	Q12260	YIG1	YPL201C	1386 nt		4.13	□□□□□ -1.75
TY2A-B	Q12260	CTT1	YGR088W	1689 nt		4.13	□□□□□ -1.75
TY2A-B	Q12260	RAD16	YBR114W	2373 nt		4.12	□□□□□ -1.75
TY2A-B	Q12260	YOR365C	YOR365C	2112 nt		4.12	□□□□□ -1.75
TY2A-B	Q12260	UBX5	YDR330W	1503 nt		4.12	□□□□□ -1.75
TY2A-B	Q12260	TEL1	YBL088C	8364 nt		4.12	□□□□□ -1.75
TY2A-B	Q12260	BSC2	YDR275W	708 nt		4.12	□□□□□ -1.75
TY2A-B	Q12260	YGL117W	YGL117W	798 nt		4.12	□□□□□ -1.75
TY2A-B	Q12260	LIP2	YLR239C	987 nt		4.12	□□□□□ -1.75
TY2A-B	Q12260	YLR339C	YLR339C	552 nt		4.12	□□□□□ -1.75
TY2A-B	Q12260	TRI1	YMR233W	681 nt		4.12	□□□□□ -1.75
TY2A-B	Q12260	PEP4	YPL154C	1218 nt		4.12	□□□□□ -1.75
TY2A-B	Q12260	OM14	YBR230C	405 nt		4.12	□□□□□ -1.75
TY2A-B	Q12260	MTH1	YDR277C	1302 nt		4.12	□□□□□ -1.75
TY2A-B	Q12260	THI20	YOL055C	1656 nt		4.12	□□□□□ -1.75
TY2A-B	Q12260	PEP5	YMR231W	3090 nt		4.12	□□□□□ -1.75

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