Protein–RNA interactions for Protein: Q09428

ABCC8, ATP-binding cassette sub-family C member 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC8Q09428 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
ABCC8Q09428 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
ABCC8Q09428 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC37.58■■■■□ 3.61
ABCC8Q09428 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC37.58■■■■□ 3.61
ABCC8Q09428 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC37.58■■■■□ 3.61
ABCC8Q09428 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
ABCC8Q09428 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
ABCC8Q09428 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC37.57■■■■□ 3.6
ABCC8Q09428 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
ABCC8Q09428 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
ABCC8Q09428 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
ABCC8Q09428 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC37.57■■■■□ 3.6
ABCC8Q09428 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
ABCC8Q09428 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
ABCC8Q09428 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
ABCC8Q09428 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.57■■■■□ 3.6
ABCC8Q09428 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC37.56■■■■□ 3.6
ABCC8Q09428 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
ABCC8Q09428 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.56■■■■□ 3.6
ABCC8Q09428 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC37.56■■■■□ 3.6
ABCC8Q09428 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC37.56■■■■□ 3.6
ABCC8Q09428 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.56■■■■□ 3.6
ABCC8Q09428 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
ABCC8Q09428 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
ABCC8Q09428 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC37.56■■■■□ 3.6
ABCC8Q09428 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
ABCC8Q09428 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC37.55■■■■□ 3.6
ABCC8Q09428 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC37.55■■■■□ 3.6
ABCC8Q09428 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC37.55■■■■□ 3.6
ABCC8Q09428 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
ABCC8Q09428 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC37.55■■■■□ 3.6
ABCC8Q09428 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC37.55■■■■□ 3.6
ABCC8Q09428 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
ABCC8Q09428 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
ABCC8Q09428 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.54■■■■□ 3.6
ABCC8Q09428 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
ABCC8Q09428 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC37.54■■■■□ 3.6
ABCC8Q09428 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.54■■■■□ 3.6
ABCC8Q09428 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
ABCC8Q09428 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC37.53■■■■□ 3.6
ABCC8Q09428 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC37.53■■■■□ 3.6
ABCC8Q09428 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC37.53■■■■□ 3.6
ABCC8Q09428 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
ABCC8Q09428 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
ABCC8Q09428 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
ABCC8Q09428 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.52■■■■□ 3.6
ABCC8Q09428 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.52■■■■□ 3.6
ABCC8Q09428 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC37.52■■■■□ 3.6
ABCC8Q09428 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC37.52■■■■□ 3.6
ABCC8Q09428 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
ABCC8Q09428 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
ABCC8Q09428 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
ABCC8Q09428 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC37.51■■■■□ 3.6
ABCC8Q09428 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC37.51■■■■□ 3.6
ABCC8Q09428 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC37.51■■■■□ 3.59
ABCC8Q09428 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC37.51■■■■□ 3.59
ABCC8Q09428 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
ABCC8Q09428 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC37.51■■■■□ 3.59
ABCC8Q09428 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC37.51■■■■□ 3.59
ABCC8Q09428 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.5■■■■□ 3.59
ABCC8Q09428 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC37.5■■■■□ 3.59
ABCC8Q09428 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.5■■■■□ 3.59
ABCC8Q09428 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
ABCC8Q09428 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.5■■■■□ 3.59
ABCC8Q09428 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC37.5■■■■□ 3.59
ABCC8Q09428 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC37.5■■■■□ 3.59
ABCC8Q09428 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.49■■■■□ 3.59
ABCC8Q09428 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
ABCC8Q09428 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC37.49■■■■□ 3.59
ABCC8Q09428 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.48■■■■□ 3.59
ABCC8Q09428 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
ABCC8Q09428 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.48■■■■□ 3.59
ABCC8Q09428 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
ABCC8Q09428 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
ABCC8Q09428 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
ABCC8Q09428 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC37.48■■■■□ 3.59
ABCC8Q09428 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC37.48■■■■□ 3.59
ABCC8Q09428 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC37.48■■■■□ 3.59
ABCC8Q09428 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
ABCC8Q09428 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
ABCC8Q09428 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
ABCC8Q09428 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC37.47■■■■□ 3.59
ABCC8Q09428 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC37.46■■■■□ 3.59
ABCC8Q09428 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
ABCC8Q09428 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
ABCC8Q09428 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC37.46■■■■□ 3.59
ABCC8Q09428 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC37.46■■■■□ 3.59
ABCC8Q09428 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC37.46■■■■□ 3.59
ABCC8Q09428 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
ABCC8Q09428 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
ABCC8Q09428 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC37.45■■■■□ 3.59
ABCC8Q09428 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
ABCC8Q09428 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC37.45■■■■□ 3.59
ABCC8Q09428 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
ABCC8Q09428 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.44■■■■□ 3.58
ABCC8Q09428 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC37.44■■■■□ 3.58
ABCC8Q09428 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.44■■■■□ 3.58
ABCC8Q09428 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
ABCC8Q09428 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.44■■■■□ 3.58
ABCC8Q09428 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms