Protein–RNA interactions for Protein: Q07889

SOS1, Son of sevenless homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOS1Q07889 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SOS1Q07889 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SOS1Q07889 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SOS1Q07889 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
SOS1Q07889 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SOS1Q07889 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
SOS1Q07889 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
SOS1Q07889 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
SOS1Q07889 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SOS1Q07889 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SOS1Q07889 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SOS1Q07889 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SOS1Q07889 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SOS1Q07889 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SOS1Q07889 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SOS1Q07889 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SOS1Q07889 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SOS1Q07889 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SOS1Q07889 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SOS1Q07889 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SOS1Q07889 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SOS1Q07889 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
SOS1Q07889 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SOS1Q07889 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
SOS1Q07889 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SOS1Q07889 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
SOS1Q07889 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SOS1Q07889 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
SOS1Q07889 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
SOS1Q07889 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
SOS1Q07889 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SOS1Q07889 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SOS1Q07889 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SOS1Q07889 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SOS1Q07889 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SOS1Q07889 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SOS1Q07889 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SOS1Q07889 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SOS1Q07889 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SOS1Q07889 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SOS1Q07889 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SOS1Q07889 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SOS1Q07889 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SOS1Q07889 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
SOS1Q07889 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SOS1Q07889 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SOS1Q07889 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SOS1Q07889 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SOS1Q07889 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SOS1Q07889 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
SOS1Q07889 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SOS1Q07889 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SOS1Q07889 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SOS1Q07889 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SOS1Q07889 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SOS1Q07889 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SOS1Q07889 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SOS1Q07889 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SOS1Q07889 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
SOS1Q07889 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SOS1Q07889 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SOS1Q07889 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SOS1Q07889 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SOS1Q07889 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SOS1Q07889 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SOS1Q07889 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SOS1Q07889 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SOS1Q07889 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SOS1Q07889 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SOS1Q07889 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SOS1Q07889 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SOS1Q07889 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SOS1Q07889 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SOS1Q07889 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SOS1Q07889 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SOS1Q07889 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SOS1Q07889 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SOS1Q07889 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
SOS1Q07889 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
SOS1Q07889 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SOS1Q07889 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SOS1Q07889 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SOS1Q07889 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SOS1Q07889 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SOS1Q07889 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SOS1Q07889 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SOS1Q07889 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SOS1Q07889 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SOS1Q07889 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SOS1Q07889 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SOS1Q07889 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SOS1Q07889 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SOS1Q07889 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SOS1Q07889 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SOS1Q07889 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
SOS1Q07889 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SOS1Q07889 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SOS1Q07889 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SOS1Q07889 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
SOS1Q07889 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms