Protein–RNA interactions for Protein: Q07699

SCN1B, Sodium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN1BQ07699 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SCN1BQ07699 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SCN1BQ07699 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SCN1BQ07699 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SCN1BQ07699 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SCN1BQ07699 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SCN1BQ07699 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SCN1BQ07699 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SCN1BQ07699 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SCN1BQ07699 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SCN1BQ07699 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SCN1BQ07699 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SCN1BQ07699 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SCN1BQ07699 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SCN1BQ07699 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SCN1BQ07699 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SCN1BQ07699 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SCN1BQ07699 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SCN1BQ07699 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SCN1BQ07699 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SCN1BQ07699 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SCN1BQ07699 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SCN1BQ07699 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SCN1BQ07699 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SCN1BQ07699 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SCN1BQ07699 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SCN1BQ07699 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SCN1BQ07699 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SCN1BQ07699 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SCN1BQ07699 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SCN1BQ07699 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SCN1BQ07699 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SCN1BQ07699 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SCN1BQ07699 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SCN1BQ07699 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SCN1BQ07699 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SCN1BQ07699 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SCN1BQ07699 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SCN1BQ07699 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SCN1BQ07699 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SCN1BQ07699 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SCN1BQ07699 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SCN1BQ07699 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SCN1BQ07699 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SCN1BQ07699 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SCN1BQ07699 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SCN1BQ07699 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SCN1BQ07699 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SCN1BQ07699 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SCN1BQ07699 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SCN1BQ07699 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SCN1BQ07699 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SCN1BQ07699 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SCN1BQ07699 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SCN1BQ07699 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SCN1BQ07699 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SCN1BQ07699 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
SCN1BQ07699 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SCN1BQ07699 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SCN1BQ07699 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SCN1BQ07699 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
SCN1BQ07699 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SCN1BQ07699 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SCN1BQ07699 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SCN1BQ07699 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SCN1BQ07699 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SCN1BQ07699 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SCN1BQ07699 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SCN1BQ07699 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SCN1BQ07699 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SCN1BQ07699 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SCN1BQ07699 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SCN1BQ07699 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SCN1BQ07699 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SCN1BQ07699 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SCN1BQ07699 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SCN1BQ07699 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SCN1BQ07699 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SCN1BQ07699 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SCN1BQ07699 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SCN1BQ07699 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SCN1BQ07699 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SCN1BQ07699 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SCN1BQ07699 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SCN1BQ07699 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SCN1BQ07699 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SCN1BQ07699 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SCN1BQ07699 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SCN1BQ07699 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SCN1BQ07699 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SCN1BQ07699 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SCN1BQ07699 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SCN1BQ07699 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SCN1BQ07699 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SCN1BQ07699 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SCN1BQ07699 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SCN1BQ07699 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SCN1BQ07699 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SCN1BQ07699 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SCN1BQ07699 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms