Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TFF3Q07654 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TFF3Q07654 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TFF3Q07654 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TFF3Q07654 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TFF3Q07654 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TFF3Q07654 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TFF3Q07654 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TFF3Q07654 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TFF3Q07654 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TFF3Q07654 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TFF3Q07654 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TFF3Q07654 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TFF3Q07654 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TFF3Q07654 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TFF3Q07654 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TFF3Q07654 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TFF3Q07654 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TFF3Q07654 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TFF3Q07654 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TFF3Q07654 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TFF3Q07654 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TFF3Q07654 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TFF3Q07654 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TFF3Q07654 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TFF3Q07654 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TFF3Q07654 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TFF3Q07654 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TFF3Q07654 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TFF3Q07654 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TFF3Q07654 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TFF3Q07654 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TFF3Q07654 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TFF3Q07654 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TFF3Q07654 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TFF3Q07654 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TFF3Q07654 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TFF3Q07654 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TFF3Q07654 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TFF3Q07654 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TFF3Q07654 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
TFF3Q07654 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TFF3Q07654 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TFF3Q07654 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TFF3Q07654 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TFF3Q07654 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TFF3Q07654 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TFF3Q07654 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TFF3Q07654 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TFF3Q07654 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TFF3Q07654 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TFF3Q07654 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TFF3Q07654 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TFF3Q07654 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TFF3Q07654 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TFF3Q07654 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TFF3Q07654 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TFF3Q07654 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TFF3Q07654 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TFF3Q07654 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TFF3Q07654 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TFF3Q07654 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TFF3Q07654 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TFF3Q07654 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TFF3Q07654 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TFF3Q07654 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TFF3Q07654 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TFF3Q07654 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TFF3Q07654 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TFF3Q07654 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TFF3Q07654 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TFF3Q07654 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TFF3Q07654 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TFF3Q07654 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TFF3Q07654 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TFF3Q07654 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TFF3Q07654 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TFF3Q07654 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TFF3Q07654 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TFF3Q07654 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TFF3Q07654 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TFF3Q07654 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TFF3Q07654 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TFF3Q07654 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TFF3Q07654 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TFF3Q07654 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TFF3Q07654 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TFF3Q07654 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TFF3Q07654 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TFF3Q07654 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TFF3Q07654 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TFF3Q07654 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TFF3Q07654 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TFF3Q07654 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TFF3Q07654 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TFF3Q07654 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TFF3Q07654 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TFF3Q07654 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TFF3Q07654 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TFF3Q07654 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms