Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TNP2Q05952 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TNP2Q05952 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TNP2Q05952 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TNP2Q05952 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
TNP2Q05952 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TNP2Q05952 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TNP2Q05952 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TNP2Q05952 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TNP2Q05952 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TNP2Q05952 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
TNP2Q05952 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TNP2Q05952 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TNP2Q05952 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TNP2Q05952 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TNP2Q05952 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TNP2Q05952 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TNP2Q05952 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TNP2Q05952 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TNP2Q05952 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TNP2Q05952 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TNP2Q05952 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TNP2Q05952 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TNP2Q05952 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TNP2Q05952 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TNP2Q05952 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TNP2Q05952 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TNP2Q05952 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TNP2Q05952 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TNP2Q05952 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TNP2Q05952 AC132872.1-201ENST00000566986 1195 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TNP2Q05952 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TNP2Q05952 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TNP2Q05952 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TNP2Q05952 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TNP2Q05952 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TNP2Q05952 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TNP2Q05952 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TNP2Q05952 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNP2Q05952 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TNP2Q05952 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNP2Q05952 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNP2Q05952 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNP2Q05952 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNP2Q05952 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNP2Q05952 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNP2Q05952 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNP2Q05952 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNP2Q05952 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNP2Q05952 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNP2Q05952 AC090142.2-201ENST00000483263 416 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TNP2Q05952 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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TNP2Q05952 BX547991.1-201ENST00000582543 1206 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNP2Q05952 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNP2Q05952 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNP2Q05952 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNP2Q05952 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNP2Q05952 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNP2Q05952 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNP2Q05952 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNP2Q05952 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNP2Q05952 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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TNP2Q05952 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNP2Q05952 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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TNP2Q05952 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNP2Q05952 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNP2Q05952 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNP2Q05952 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNP2Q05952 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNP2Q05952 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNP2Q05952 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNP2Q05952 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNP2Q05952 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNP2Q05952 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TNP2Q05952 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TNP2Q05952 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TNP2Q05952 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TNP2Q05952 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TNP2Q05952 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TNP2Q05952 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TNP2Q05952 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TNP2Q05952 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TNP2Q05952 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TNP2Q05952 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TNP2Q05952 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TNP2Q05952 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TNP2Q05952 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
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