Protein–RNA interactions for Protein: Q04695

KRT17, Keratin, type I cytoskeletal 17, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT17Q04695 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT17Q04695 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT17Q04695 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT17Q04695 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT17Q04695 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT17Q04695 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT17Q04695 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT17Q04695 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT17Q04695 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT17Q04695 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
KRT17Q04695 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
KRT17Q04695 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
KRT17Q04695 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT17Q04695 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT17Q04695 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT17Q04695 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT17Q04695 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT17Q04695 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT17Q04695 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT17Q04695 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT17Q04695 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT17Q04695 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT17Q04695 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT17Q04695 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT17Q04695 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT17Q04695 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT17Q04695 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT17Q04695 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT17Q04695 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT17Q04695 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT17Q04695 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT17Q04695 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT17Q04695 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT17Q04695 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT17Q04695 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT17Q04695 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT17Q04695 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT17Q04695 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT17Q04695 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT17Q04695 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT17Q04695 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT17Q04695 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT17Q04695 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT17Q04695 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT17Q04695 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT17Q04695 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT17Q04695 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT17Q04695 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT17Q04695 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT17Q04695 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT17Q04695 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT17Q04695 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT17Q04695 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT17Q04695 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT17Q04695 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT17Q04695 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT17Q04695 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT17Q04695 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT17Q04695 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT17Q04695 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT17Q04695 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT17Q04695 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT17Q04695 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT17Q04695 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT17Q04695 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT17Q04695 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT17Q04695 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT17Q04695 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT17Q04695 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT17Q04695 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT17Q04695 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT17Q04695 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT17Q04695 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT17Q04695 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT17Q04695 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT17Q04695 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT17Q04695 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT17Q04695 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT17Q04695 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KRT17Q04695 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
KRT17Q04695 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
KRT17Q04695 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KRT17Q04695 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
KRT17Q04695 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT17Q04695 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT17Q04695 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT17Q04695 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT17Q04695 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT17Q04695 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT17Q04695 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT17Q04695 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT17Q04695 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT17Q04695 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT17Q04695 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT17Q04695 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT17Q04695 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT17Q04695 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT17Q04695 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT17Q04695 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT17Q04695 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms