Protein–RNA interactions for Protein: Q03135

CAV1, Caveolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV1Q03135 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAV1Q03135 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAV1Q03135 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAV1Q03135 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAV1Q03135 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAV1Q03135 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAV1Q03135 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAV1Q03135 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAV1Q03135 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CAV1Q03135 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CAV1Q03135 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAV1Q03135 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAV1Q03135 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CAV1Q03135 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAV1Q03135 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAV1Q03135 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAV1Q03135 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAV1Q03135 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAV1Q03135 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAV1Q03135 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAV1Q03135 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAV1Q03135 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAV1Q03135 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAV1Q03135 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAV1Q03135 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAV1Q03135 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAV1Q03135 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAV1Q03135 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAV1Q03135 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAV1Q03135 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAV1Q03135 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAV1Q03135 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAV1Q03135 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAV1Q03135 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAV1Q03135 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAV1Q03135 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAV1Q03135 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CAV1Q03135 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAV1Q03135 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CAV1Q03135 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CAV1Q03135 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAV1Q03135 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAV1Q03135 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAV1Q03135 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAV1Q03135 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAV1Q03135 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAV1Q03135 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAV1Q03135 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAV1Q03135 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAV1Q03135 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAV1Q03135 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAV1Q03135 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAV1Q03135 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAV1Q03135 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAV1Q03135 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAV1Q03135 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAV1Q03135 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAV1Q03135 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAV1Q03135 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAV1Q03135 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CAV1Q03135 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAV1Q03135 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAV1Q03135 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAV1Q03135 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAV1Q03135 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAV1Q03135 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAV1Q03135 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAV1Q03135 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAV1Q03135 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAV1Q03135 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CAV1Q03135 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAV1Q03135 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAV1Q03135 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAV1Q03135 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAV1Q03135 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAV1Q03135 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAV1Q03135 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CAV1Q03135 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAV1Q03135 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAV1Q03135 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAV1Q03135 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAV1Q03135 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAV1Q03135 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAV1Q03135 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAV1Q03135 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAV1Q03135 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAV1Q03135 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAV1Q03135 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CAV1Q03135 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CAV1Q03135 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAV1Q03135 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAV1Q03135 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAV1Q03135 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAV1Q03135 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAV1Q03135 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAV1Q03135 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAV1Q03135 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAV1Q03135 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAV1Q03135 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAV1Q03135 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms