Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NHLH2Q02577 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NHLH2Q02577 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NHLH2Q02577 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NHLH2Q02577 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NHLH2Q02577 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
NHLH2Q02577 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NHLH2Q02577 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NHLH2Q02577 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NHLH2Q02577 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NHLH2Q02577 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NHLH2Q02577 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NHLH2Q02577 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NHLH2Q02577 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NHLH2Q02577 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NHLH2Q02577 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NHLH2Q02577 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
NHLH2Q02577 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NHLH2Q02577 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NHLH2Q02577 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
NHLH2Q02577 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
NHLH2Q02577 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NHLH2Q02577 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NHLH2Q02577 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NHLH2Q02577 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NHLH2Q02577 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NHLH2Q02577 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NHLH2Q02577 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NHLH2Q02577 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NHLH2Q02577 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NHLH2Q02577 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NHLH2Q02577 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
NHLH2Q02577 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NHLH2Q02577 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NHLH2Q02577 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NHLH2Q02577 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NHLH2Q02577 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NHLH2Q02577 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NHLH2Q02577 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NHLH2Q02577 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NHLH2Q02577 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NHLH2Q02577 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NHLH2Q02577 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NHLH2Q02577 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NHLH2Q02577 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NHLH2Q02577 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NHLH2Q02577 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NHLH2Q02577 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NHLH2Q02577 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NHLH2Q02577 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NHLH2Q02577 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NHLH2Q02577 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
NHLH2Q02577 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NHLH2Q02577 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NHLH2Q02577 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NHLH2Q02577 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NHLH2Q02577 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NHLH2Q02577 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NHLH2Q02577 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NHLH2Q02577 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NHLH2Q02577 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NHLH2Q02577 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NHLH2Q02577 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
NHLH2Q02577 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NHLH2Q02577 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NHLH2Q02577 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NHLH2Q02577 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NHLH2Q02577 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NHLH2Q02577 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NHLH2Q02577 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NHLH2Q02577 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NHLH2Q02577 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NHLH2Q02577 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NHLH2Q02577 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NHLH2Q02577 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NHLH2Q02577 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NHLH2Q02577 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NHLH2Q02577 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
NHLH2Q02577 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NHLH2Q02577 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NHLH2Q02577 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NHLH2Q02577 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
NHLH2Q02577 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NHLH2Q02577 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NHLH2Q02577 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NHLH2Q02577 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NHLH2Q02577 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NHLH2Q02577 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
NHLH2Q02577 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NHLH2Q02577 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NHLH2Q02577 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NHLH2Q02577 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NHLH2Q02577 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NHLH2Q02577 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NHLH2Q02577 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NHLH2Q02577 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NHLH2Q02577 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NHLH2Q02577 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NHLH2Q02577 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NHLH2Q02577 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms