Protein–RNA interactions for Protein: Q01970

PLCB3, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLCB3Q01970 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PLCB3Q01970 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PLCB3Q01970 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PLCB3Q01970 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PLCB3Q01970 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PLCB3Q01970 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PLCB3Q01970 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PLCB3Q01970 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PLCB3Q01970 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PLCB3Q01970 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PLCB3Q01970 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PLCB3Q01970 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PLCB3Q01970 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PLCB3Q01970 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PLCB3Q01970 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PLCB3Q01970 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PLCB3Q01970 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PLCB3Q01970 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PLCB3Q01970 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PLCB3Q01970 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PLCB3Q01970 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PLCB3Q01970 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PLCB3Q01970 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PLCB3Q01970 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PLCB3Q01970 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PLCB3Q01970 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PLCB3Q01970 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PLCB3Q01970 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PLCB3Q01970 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PLCB3Q01970 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PLCB3Q01970 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PLCB3Q01970 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PLCB3Q01970 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PLCB3Q01970 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PLCB3Q01970 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
PLCB3Q01970 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PLCB3Q01970 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PLCB3Q01970 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PLCB3Q01970 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PLCB3Q01970 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PLCB3Q01970 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PLCB3Q01970 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PLCB3Q01970 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PLCB3Q01970 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PLCB3Q01970 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PLCB3Q01970 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PLCB3Q01970 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PLCB3Q01970 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PLCB3Q01970 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PLCB3Q01970 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PLCB3Q01970 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PLCB3Q01970 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PLCB3Q01970 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PLCB3Q01970 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PLCB3Q01970 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PLCB3Q01970 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PLCB3Q01970 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PLCB3Q01970 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PLCB3Q01970 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PLCB3Q01970 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PLCB3Q01970 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PLCB3Q01970 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PLCB3Q01970 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PLCB3Q01970 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PLCB3Q01970 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PLCB3Q01970 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PLCB3Q01970 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PLCB3Q01970 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PLCB3Q01970 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PLCB3Q01970 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PLCB3Q01970 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PLCB3Q01970 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PLCB3Q01970 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PLCB3Q01970 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PLCB3Q01970 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PLCB3Q01970 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PLCB3Q01970 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PLCB3Q01970 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PLCB3Q01970 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PLCB3Q01970 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PLCB3Q01970 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PLCB3Q01970 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PLCB3Q01970 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PLCB3Q01970 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PLCB3Q01970 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PLCB3Q01970 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PLCB3Q01970 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PLCB3Q01970 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PLCB3Q01970 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PLCB3Q01970 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PLCB3Q01970 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PLCB3Q01970 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PLCB3Q01970 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PLCB3Q01970 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PLCB3Q01970 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PLCB3Q01970 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PLCB3Q01970 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PLCB3Q01970 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PLCB3Q01970 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PLCB3Q01970 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms