Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC6A3Q01959 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC6A3Q01959 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC6A3Q01959 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC6A3Q01959 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC6A3Q01959 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC6A3Q01959 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC6A3Q01959 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC6A3Q01959 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC6A3Q01959 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC6A3Q01959 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC6A3Q01959 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC6A3Q01959 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC6A3Q01959 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC6A3Q01959 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC6A3Q01959 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC6A3Q01959 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC6A3Q01959 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC6A3Q01959 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC6A3Q01959 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC6A3Q01959 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC6A3Q01959 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC6A3Q01959 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC6A3Q01959 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC6A3Q01959 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC6A3Q01959 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC6A3Q01959 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC6A3Q01959 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC6A3Q01959 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC6A3Q01959 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC6A3Q01959 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC6A3Q01959 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC6A3Q01959 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC6A3Q01959 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC6A3Q01959 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC6A3Q01959 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC6A3Q01959 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC6A3Q01959 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC6A3Q01959 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC6A3Q01959 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC6A3Q01959 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC6A3Q01959 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC6A3Q01959 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC6A3Q01959 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC6A3Q01959 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC6A3Q01959 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC6A3Q01959 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC6A3Q01959 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC6A3Q01959 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC6A3Q01959 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC6A3Q01959 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC6A3Q01959 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC6A3Q01959 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC6A3Q01959 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC6A3Q01959 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC6A3Q01959 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC6A3Q01959 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC6A3Q01959 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC6A3Q01959 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC6A3Q01959 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC6A3Q01959 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC6A3Q01959 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC6A3Q01959 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC6A3Q01959 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC6A3Q01959 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC6A3Q01959 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC6A3Q01959 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC6A3Q01959 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC6A3Q01959 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC6A3Q01959 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC6A3Q01959 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC6A3Q01959 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC6A3Q01959 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC6A3Q01959 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC6A3Q01959 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC6A3Q01959 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC6A3Q01959 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC6A3Q01959 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC6A3Q01959 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC6A3Q01959 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC6A3Q01959 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC6A3Q01959 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC6A3Q01959 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC6A3Q01959 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC6A3Q01959 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC6A3Q01959 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC6A3Q01959 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC6A3Q01959 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC6A3Q01959 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC6A3Q01959 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC6A3Q01959 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC6A3Q01959 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC6A3Q01959 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC6A3Q01959 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
SLC6A3Q01959 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC6A3Q01959 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC6A3Q01959 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC6A3Q01959 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC6A3Q01959 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC6A3Q01959 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms