Protein–RNA interactions for Protein: Q01668

CACNA1D, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1D, humanhuman

Predictions only

Length 2,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1DQ01668 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CACNA1DQ01668 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CACNA1DQ01668 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CACNA1DQ01668 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CACNA1DQ01668 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CACNA1DQ01668 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CACNA1DQ01668 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CACNA1DQ01668 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CACNA1DQ01668 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CACNA1DQ01668 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CACNA1DQ01668 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CACNA1DQ01668 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CACNA1DQ01668 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CACNA1DQ01668 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CACNA1DQ01668 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CACNA1DQ01668 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CACNA1DQ01668 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CACNA1DQ01668 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CACNA1DQ01668 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CACNA1DQ01668 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CACNA1DQ01668 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CACNA1DQ01668 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CACNA1DQ01668 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CACNA1DQ01668 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CACNA1DQ01668 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CACNA1DQ01668 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CACNA1DQ01668 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CACNA1DQ01668 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CACNA1DQ01668 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CACNA1DQ01668 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CACNA1DQ01668 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CACNA1DQ01668 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CACNA1DQ01668 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CACNA1DQ01668 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CACNA1DQ01668 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CACNA1DQ01668 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CACNA1DQ01668 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CACNA1DQ01668 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CACNA1DQ01668 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CACNA1DQ01668 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CACNA1DQ01668 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CACNA1DQ01668 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CACNA1DQ01668 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CACNA1DQ01668 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CACNA1DQ01668 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CACNA1DQ01668 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CACNA1DQ01668 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CACNA1DQ01668 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CACNA1DQ01668 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CACNA1DQ01668 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CACNA1DQ01668 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CACNA1DQ01668 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CACNA1DQ01668 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CACNA1DQ01668 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CACNA1DQ01668 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CACNA1DQ01668 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CACNA1DQ01668 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CACNA1DQ01668 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CACNA1DQ01668 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CACNA1DQ01668 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNA1DQ01668 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNA1DQ01668 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNA1DQ01668 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNA1DQ01668 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNA1DQ01668 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNA1DQ01668 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNA1DQ01668 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNA1DQ01668 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNA1DQ01668 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNA1DQ01668 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNA1DQ01668 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNA1DQ01668 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNA1DQ01668 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNA1DQ01668 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNA1DQ01668 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNA1DQ01668 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNA1DQ01668 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNA1DQ01668 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNA1DQ01668 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNA1DQ01668 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNA1DQ01668 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNA1DQ01668 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNA1DQ01668 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNA1DQ01668 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNA1DQ01668 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNA1DQ01668 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNA1DQ01668 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNA1DQ01668 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNA1DQ01668 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNA1DQ01668 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNA1DQ01668 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNA1DQ01668 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNA1DQ01668 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNA1DQ01668 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNA1DQ01668 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNA1DQ01668 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNA1DQ01668 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNA1DQ01668 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNA1DQ01668 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNA1DQ01668 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms