Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
FAM3AP98173 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
FAM3AP98173 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
FAM3AP98173 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
FAM3AP98173 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
FAM3AP98173 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
FAM3AP98173 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
FAM3AP98173 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
FAM3AP98173 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
FAM3AP98173 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
FAM3AP98173 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
FAM3AP98173 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FAM3AP98173 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FAM3AP98173 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FAM3AP98173 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FAM3AP98173 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FAM3AP98173 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
FAM3AP98173 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FAM3AP98173 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FAM3AP98173 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FAM3AP98173 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FAM3AP98173 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
FAM3AP98173 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FAM3AP98173 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FAM3AP98173 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FAM3AP98173 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
FAM3AP98173 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FAM3AP98173 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
FAM3AP98173 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
FAM3AP98173 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
FAM3AP98173 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FAM3AP98173 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
FAM3AP98173 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FAM3AP98173 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FAM3AP98173 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FAM3AP98173 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
FAM3AP98173 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
FAM3AP98173 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
FAM3AP98173 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
FAM3AP98173 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
FAM3AP98173 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
FAM3AP98173 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
FAM3AP98173 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
FAM3AP98173 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
FAM3AP98173 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
FAM3AP98173 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
FAM3AP98173 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
FAM3AP98173 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
FAM3AP98173 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
FAM3AP98173 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
FAM3AP98173 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
FAM3AP98173 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
FAM3AP98173 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
FAM3AP98173 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
FAM3AP98173 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
FAM3AP98173 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
FAM3AP98173 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
FAM3AP98173 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
FAM3AP98173 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
FAM3AP98173 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
FAM3AP98173 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
FAM3AP98173 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
FAM3AP98173 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
FAM3AP98173 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
FAM3AP98173 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
FAM3AP98173 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
FAM3AP98173 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
FAM3AP98173 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
FAM3AP98173 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
FAM3AP98173 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
FAM3AP98173 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
FAM3AP98173 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
FAM3AP98173 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
FAM3AP98173 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
FAM3AP98173 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
FAM3AP98173 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
FAM3AP98173 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
FAM3AP98173 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
FAM3AP98173 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
FAM3AP98173 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
FAM3AP98173 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
FAM3AP98173 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
FAM3AP98173 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
FAM3AP98173 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
FAM3AP98173 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
FAM3AP98173 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
FAM3AP98173 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
FAM3AP98173 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
FAM3AP98173 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
FAM3AP98173 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
FAM3AP98173 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
FAM3AP98173 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FAM3AP98173 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FAM3AP98173 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FAM3AP98173 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FAM3AP98173 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FAM3AP98173 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FAM3AP98173 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FAM3AP98173 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FAM3AP98173 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
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