Protein–RNA interactions for Protein: P98172

EFNB1, Ephrin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB1P98172 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EFNB1P98172 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EFNB1P98172 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EFNB1P98172 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EFNB1P98172 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
EFNB1P98172 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
EFNB1P98172 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
EFNB1P98172 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EFNB1P98172 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EFNB1P98172 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EFNB1P98172 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EFNB1P98172 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EFNB1P98172 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EFNB1P98172 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
EFNB1P98172 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EFNB1P98172 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
EFNB1P98172 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EFNB1P98172 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EFNB1P98172 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EFNB1P98172 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EFNB1P98172 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EFNB1P98172 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EFNB1P98172 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EFNB1P98172 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EFNB1P98172 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
EFNB1P98172 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EFNB1P98172 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EFNB1P98172 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EFNB1P98172 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EFNB1P98172 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EFNB1P98172 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EFNB1P98172 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EFNB1P98172 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EFNB1P98172 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EFNB1P98172 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EFNB1P98172 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EFNB1P98172 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EFNB1P98172 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EFNB1P98172 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EFNB1P98172 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EFNB1P98172 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EFNB1P98172 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EFNB1P98172 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EFNB1P98172 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EFNB1P98172 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EFNB1P98172 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EFNB1P98172 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EFNB1P98172 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
EFNB1P98172 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EFNB1P98172 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EFNB1P98172 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EFNB1P98172 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EFNB1P98172 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
EFNB1P98172 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EFNB1P98172 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EFNB1P98172 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EFNB1P98172 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EFNB1P98172 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EFNB1P98172 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EFNB1P98172 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EFNB1P98172 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EFNB1P98172 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EFNB1P98172 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EFNB1P98172 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EFNB1P98172 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EFNB1P98172 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EFNB1P98172 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EFNB1P98172 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EFNB1P98172 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EFNB1P98172 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
EFNB1P98172 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EFNB1P98172 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EFNB1P98172 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EFNB1P98172 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EFNB1P98172 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EFNB1P98172 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
EFNB1P98172 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EFNB1P98172 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EFNB1P98172 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EFNB1P98172 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EFNB1P98172 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
EFNB1P98172 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EFNB1P98172 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
EFNB1P98172 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
EFNB1P98172 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EFNB1P98172 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EFNB1P98172 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
EFNB1P98172 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EFNB1P98172 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
EFNB1P98172 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
EFNB1P98172 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
EFNB1P98172 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EFNB1P98172 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EFNB1P98172 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EFNB1P98172 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
EFNB1P98172 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
EFNB1P98172 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
EFNB1P98172 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
EFNB1P98172 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
EFNB1P98172 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms