Protein–RNA interactions for Protein: P83436

COG7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG7P83436 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COG7P83436 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COG7P83436 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COG7P83436 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COG7P83436 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COG7P83436 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COG7P83436 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COG7P83436 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COG7P83436 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COG7P83436 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COG7P83436 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COG7P83436 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COG7P83436 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COG7P83436 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COG7P83436 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COG7P83436 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COG7P83436 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COG7P83436 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COG7P83436 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COG7P83436 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COG7P83436 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COG7P83436 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COG7P83436 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COG7P83436 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COG7P83436 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COG7P83436 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COG7P83436 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
COG7P83436 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
COG7P83436 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
COG7P83436 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COG7P83436 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COG7P83436 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COG7P83436 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COG7P83436 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COG7P83436 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COG7P83436 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COG7P83436 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COG7P83436 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COG7P83436 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COG7P83436 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COG7P83436 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COG7P83436 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COG7P83436 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COG7P83436 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
COG7P83436 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COG7P83436 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COG7P83436 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COG7P83436 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COG7P83436 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COG7P83436 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COG7P83436 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COG7P83436 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COG7P83436 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COG7P83436 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COG7P83436 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COG7P83436 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COG7P83436 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COG7P83436 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COG7P83436 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COG7P83436 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
COG7P83436 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COG7P83436 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COG7P83436 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COG7P83436 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COG7P83436 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COG7P83436 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COG7P83436 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COG7P83436 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COG7P83436 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COG7P83436 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COG7P83436 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
COG7P83436 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COG7P83436 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COG7P83436 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COG7P83436 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COG7P83436 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COG7P83436 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COG7P83436 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COG7P83436 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COG7P83436 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COG7P83436 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COG7P83436 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COG7P83436 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COG7P83436 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COG7P83436 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COG7P83436 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COG7P83436 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COG7P83436 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COG7P83436 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COG7P83436 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COG7P83436 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COG7P83436 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COG7P83436 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COG7P83436 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
COG7P83436 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COG7P83436 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COG7P83436 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COG7P83436 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COG7P83436 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COG7P83436 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.7 ms