Protein–RNA interactions for Protein: P80217

IFI35, Interferon-induced 35 kDa protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFI35P80217 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFI35P80217 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFI35P80217 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFI35P80217 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFI35P80217 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFI35P80217 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFI35P80217 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFI35P80217 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFI35P80217 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFI35P80217 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFI35P80217 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFI35P80217 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFI35P80217 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
IFI35P80217 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFI35P80217 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
IFI35P80217 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
IFI35P80217 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
IFI35P80217 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
IFI35P80217 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFI35P80217 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFI35P80217 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFI35P80217 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFI35P80217 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFI35P80217 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFI35P80217 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFI35P80217 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFI35P80217 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFI35P80217 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFI35P80217 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFI35P80217 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFI35P80217 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFI35P80217 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFI35P80217 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFI35P80217 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFI35P80217 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFI35P80217 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFI35P80217 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFI35P80217 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFI35P80217 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFI35P80217 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFI35P80217 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFI35P80217 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFI35P80217 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFI35P80217 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFI35P80217 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFI35P80217 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFI35P80217 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IFI35P80217 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IFI35P80217 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IFI35P80217 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IFI35P80217 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IFI35P80217 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IFI35P80217 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IFI35P80217 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IFI35P80217 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IFI35P80217 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFI35P80217 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFI35P80217 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFI35P80217 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFI35P80217 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFI35P80217 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
IFI35P80217 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFI35P80217 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFI35P80217 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFI35P80217 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFI35P80217 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFI35P80217 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFI35P80217 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFI35P80217 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFI35P80217 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
IFI35P80217 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFI35P80217 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
IFI35P80217 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFI35P80217 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
IFI35P80217 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFI35P80217 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFI35P80217 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFI35P80217 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
IFI35P80217 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFI35P80217 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFI35P80217 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFI35P80217 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFI35P80217 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFI35P80217 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFI35P80217 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
IFI35P80217 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
IFI35P80217 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
IFI35P80217 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
IFI35P80217 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFI35P80217 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFI35P80217 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFI35P80217 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFI35P80217 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
IFI35P80217 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFI35P80217 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFI35P80217 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFI35P80217 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFI35P80217 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFI35P80217 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFI35P80217 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms