Protein–RNA interactions for Protein: P78358

CTAG1A, Cancer/testis antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTAG1AP78358 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTAG1AP78358 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTAG1AP78358 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTAG1AP78358 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTAG1AP78358 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTAG1AP78358 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CTAG1AP78358 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTAG1AP78358 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTAG1AP78358 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTAG1AP78358 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTAG1AP78358 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTAG1AP78358 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTAG1AP78358 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTAG1AP78358 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTAG1AP78358 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTAG1AP78358 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTAG1AP78358 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTAG1AP78358 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTAG1AP78358 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTAG1AP78358 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTAG1AP78358 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTAG1AP78358 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTAG1AP78358 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTAG1AP78358 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTAG1AP78358 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTAG1AP78358 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CTAG1AP78358 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTAG1AP78358 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTAG1AP78358 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTAG1AP78358 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTAG1AP78358 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTAG1AP78358 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTAG1AP78358 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTAG1AP78358 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTAG1AP78358 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTAG1AP78358 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTAG1AP78358 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTAG1AP78358 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTAG1AP78358 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTAG1AP78358 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTAG1AP78358 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTAG1AP78358 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTAG1AP78358 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTAG1AP78358 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTAG1AP78358 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTAG1AP78358 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTAG1AP78358 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTAG1AP78358 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTAG1AP78358 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTAG1AP78358 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTAG1AP78358 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTAG1AP78358 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTAG1AP78358 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTAG1AP78358 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTAG1AP78358 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTAG1AP78358 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTAG1AP78358 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTAG1AP78358 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTAG1AP78358 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTAG1AP78358 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTAG1AP78358 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTAG1AP78358 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTAG1AP78358 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTAG1AP78358 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTAG1AP78358 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTAG1AP78358 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTAG1AP78358 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTAG1AP78358 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTAG1AP78358 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTAG1AP78358 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTAG1AP78358 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTAG1AP78358 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTAG1AP78358 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTAG1AP78358 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTAG1AP78358 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTAG1AP78358 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CTAG1AP78358 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTAG1AP78358 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTAG1AP78358 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTAG1AP78358 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTAG1AP78358 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTAG1AP78358 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTAG1AP78358 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTAG1AP78358 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTAG1AP78358 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTAG1AP78358 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTAG1AP78358 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CTAG1AP78358 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CTAG1AP78358 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CTAG1AP78358 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTAG1AP78358 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTAG1AP78358 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTAG1AP78358 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTAG1AP78358 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTAG1AP78358 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTAG1AP78358 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTAG1AP78358 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTAG1AP78358 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTAG1AP78358 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTAG1AP78358 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms