Protein–RNA interactions for Protein: P63208

SKP1, S-phase kinase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP1P63208 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SKP1P63208 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SKP1P63208 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SKP1P63208 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SKP1P63208 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SKP1P63208 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SKP1P63208 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SKP1P63208 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SKP1P63208 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SKP1P63208 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SKP1P63208 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SKP1P63208 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SKP1P63208 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SKP1P63208 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SKP1P63208 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SKP1P63208 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SKP1P63208 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SKP1P63208 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SKP1P63208 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SKP1P63208 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SKP1P63208 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SKP1P63208 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SKP1P63208 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SKP1P63208 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SKP1P63208 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SKP1P63208 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SKP1P63208 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SKP1P63208 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SKP1P63208 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SKP1P63208 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SKP1P63208 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SKP1P63208 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SKP1P63208 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SKP1P63208 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SKP1P63208 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SKP1P63208 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SKP1P63208 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SKP1P63208 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SKP1P63208 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SKP1P63208 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SKP1P63208 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SKP1P63208 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SKP1P63208 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SKP1P63208 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SKP1P63208 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SKP1P63208 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SKP1P63208 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SKP1P63208 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SKP1P63208 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SKP1P63208 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SKP1P63208 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SKP1P63208 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SKP1P63208 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SKP1P63208 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SKP1P63208 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SKP1P63208 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SKP1P63208 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SKP1P63208 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SKP1P63208 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SKP1P63208 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SKP1P63208 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SKP1P63208 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SKP1P63208 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SKP1P63208 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SKP1P63208 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SKP1P63208 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SKP1P63208 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SKP1P63208 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SKP1P63208 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SKP1P63208 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SKP1P63208 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SKP1P63208 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SKP1P63208 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SKP1P63208 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SKP1P63208 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SKP1P63208 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SKP1P63208 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SKP1P63208 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SKP1P63208 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SKP1P63208 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SKP1P63208 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SKP1P63208 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SKP1P63208 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SKP1P63208 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SKP1P63208 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SKP1P63208 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SKP1P63208 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SKP1P63208 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SKP1P63208 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SKP1P63208 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SKP1P63208 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SKP1P63208 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SKP1P63208 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SKP1P63208 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SKP1P63208 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SKP1P63208 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SKP1P63208 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SKP1P63208 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SKP1P63208 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SKP1P63208 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms