Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERVK_113P61574 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERVK_113P61574 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERVK_113P61574 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERVK_113P61574 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERVK_113P61574 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERVK_113P61574 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERVK_113P61574 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERVK_113P61574 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERVK_113P61574 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERVK_113P61574 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERVK_113P61574 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERVK_113P61574 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERVK_113P61574 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERVK_113P61574 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERVK_113P61574 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HERVK_113P61574 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERVK_113P61574 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERVK_113P61574 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERVK_113P61574 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERVK_113P61574 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERVK_113P61574 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERVK_113P61574 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERVK_113P61574 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERVK_113P61574 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERVK_113P61574 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERVK_113P61574 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERVK_113P61574 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERVK_113P61574 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERVK_113P61574 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERVK_113P61574 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERVK_113P61574 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERVK_113P61574 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERVK_113P61574 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HERVK_113P61574 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERVK_113P61574 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERVK_113P61574 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERVK_113P61574 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERVK_113P61574 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERVK_113P61574 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERVK_113P61574 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERVK_113P61574 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERVK_113P61574 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERVK_113P61574 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERVK_113P61574 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HERVK_113P61574 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERVK_113P61574 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERVK_113P61574 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERVK_113P61574 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERVK_113P61574 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HERVK_113P61574 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERVK_113P61574 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERVK_113P61574 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERVK_113P61574 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERVK_113P61574 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERVK_113P61574 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERVK_113P61574 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERVK_113P61574 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERVK_113P61574 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERVK_113P61574 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HERVK_113P61574 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERVK_113P61574 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERVK_113P61574 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERVK_113P61574 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERVK_113P61574 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERVK_113P61574 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERVK_113P61574 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERVK_113P61574 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERVK_113P61574 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERVK_113P61574 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HERVK_113P61574 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERVK_113P61574 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERVK_113P61574 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERVK_113P61574 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERVK_113P61574 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERVK_113P61574 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERVK_113P61574 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERVK_113P61574 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HERVK_113P61574 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERVK_113P61574 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERVK_113P61574 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERVK_113P61574 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HERVK_113P61574 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HERVK_113P61574 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HERVK_113P61574 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HERVK_113P61574 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HERVK_113P61574 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HERVK_113P61574 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HERVK_113P61574 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HERVK_113P61574 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HERVK_113P61574 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HERVK_113P61574 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HERVK_113P61574 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HERVK_113P61574 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERVK_113P61574 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERVK_113P61574 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERVK_113P61574 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERVK_113P61574 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERVK_113P61574 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERVK_113P61574 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms