Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ERVPABLB-1P60509 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ERVPABLB-1P60509 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ERVPABLB-1P60509 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ERVPABLB-1P60509 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ERVPABLB-1P60509 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ERVPABLB-1P60509 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ERVPABLB-1P60509 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ERVPABLB-1P60509 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ERVPABLB-1P60509 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ERVPABLB-1P60509 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ERVPABLB-1P60509 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ERVPABLB-1P60509 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ERVPABLB-1P60509 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ERVPABLB-1P60509 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ERVPABLB-1P60509 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ERVPABLB-1P60509 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ERVPABLB-1P60509 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ERVPABLB-1P60509 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ERVPABLB-1P60509 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ERVPABLB-1P60509 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ERVPABLB-1P60509 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ERVPABLB-1P60509 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ERVPABLB-1P60509 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ERVPABLB-1P60509 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ERVPABLB-1P60509 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ERVPABLB-1P60509 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ERVPABLB-1P60509 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ERVPABLB-1P60509 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ERVPABLB-1P60509 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ERVPABLB-1P60509 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ERVPABLB-1P60509 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ERVPABLB-1P60509 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ERVPABLB-1P60509 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ERVPABLB-1P60509 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ERVPABLB-1P60509 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ERVPABLB-1P60509 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ERVPABLB-1P60509 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ERVPABLB-1P60509 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ERVPABLB-1P60509 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ERVPABLB-1P60509 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ERVPABLB-1P60509 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ERVPABLB-1P60509 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ERVPABLB-1P60509 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ERVPABLB-1P60509 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ERVPABLB-1P60509 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ERVPABLB-1P60509 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ERVPABLB-1P60509 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ERVPABLB-1P60509 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ERVPABLB-1P60509 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ERVPABLB-1P60509 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ERVPABLB-1P60509 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ERVPABLB-1P60509 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ERVPABLB-1P60509 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ERVPABLB-1P60509 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ERVPABLB-1P60509 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ERVPABLB-1P60509 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ERVPABLB-1P60509 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ERVPABLB-1P60509 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ERVPABLB-1P60509 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ERVPABLB-1P60509 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ERVPABLB-1P60509 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ERVPABLB-1P60509 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ERVPABLB-1P60509 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ERVPABLB-1P60509 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ERVPABLB-1P60509 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ERVPABLB-1P60509 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ERVPABLB-1P60509 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ERVPABLB-1P60509 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ERVPABLB-1P60509 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ERVPABLB-1P60509 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ERVPABLB-1P60509 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ERVPABLB-1P60509 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ERVPABLB-1P60509 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ERVPABLB-1P60509 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ERVPABLB-1P60509 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ERVPABLB-1P60509 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ERVPABLB-1P60509 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ERVPABLB-1P60509 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ERVPABLB-1P60509 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ERVPABLB-1P60509 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ERVPABLB-1P60509 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ERVPABLB-1P60509 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ERVPABLB-1P60509 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ERVPABLB-1P60509 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ERVPABLB-1P60509 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ERVPABLB-1P60509 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ERVPABLB-1P60509 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ERVPABLB-1P60509 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ERVPABLB-1P60509 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ERVPABLB-1P60509 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ERVPABLB-1P60509 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ERVPABLB-1P60509 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ERVPABLB-1P60509 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ERVPABLB-1P60509 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ERVPABLB-1P60509 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ERVPABLB-1P60509 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ERVPABLB-1P60509 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVPABLB-1P60509 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVPABLB-1P60509 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms