Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NUP107P57740 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NUP107P57740 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NUP107P57740 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NUP107P57740 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NUP107P57740 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NUP107P57740 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NUP107P57740 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NUP107P57740 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NUP107P57740 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NUP107P57740 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NUP107P57740 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NUP107P57740 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NUP107P57740 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NUP107P57740 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NUP107P57740 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NUP107P57740 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NUP107P57740 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NUP107P57740 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NUP107P57740 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NUP107P57740 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NUP107P57740 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NUP107P57740 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NUP107P57740 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NUP107P57740 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NUP107P57740 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NUP107P57740 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NUP107P57740 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NUP107P57740 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NUP107P57740 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NUP107P57740 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NUP107P57740 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NUP107P57740 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NUP107P57740 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NUP107P57740 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NUP107P57740 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NUP107P57740 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NUP107P57740 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NUP107P57740 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NUP107P57740 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NUP107P57740 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NUP107P57740 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NUP107P57740 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
NUP107P57740 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NUP107P57740 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NUP107P57740 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NUP107P57740 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
NUP107P57740 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
NUP107P57740 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
NUP107P57740 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
NUP107P57740 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
NUP107P57740 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NUP107P57740 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NUP107P57740 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NUP107P57740 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NUP107P57740 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NUP107P57740 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NUP107P57740 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NUP107P57740 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NUP107P57740 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NUP107P57740 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NUP107P57740 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NUP107P57740 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NUP107P57740 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NUP107P57740 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NUP107P57740 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NUP107P57740 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NUP107P57740 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NUP107P57740 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NUP107P57740 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NUP107P57740 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
NUP107P57740 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NUP107P57740 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NUP107P57740 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NUP107P57740 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NUP107P57740 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NUP107P57740 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NUP107P57740 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NUP107P57740 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NUP107P57740 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NUP107P57740 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NUP107P57740 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NUP107P57740 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NUP107P57740 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NUP107P57740 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NUP107P57740 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NUP107P57740 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NUP107P57740 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NUP107P57740 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
NUP107P57740 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NUP107P57740 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NUP107P57740 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NUP107P57740 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NUP107P57740 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NUP107P57740 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NUP107P57740 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NUP107P57740 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NUP107P57740 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NUP107P57740 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NUP107P57740 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms