Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BACE1P56817 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BACE1P56817 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
BACE1P56817 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BACE1P56817 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BACE1P56817 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BACE1P56817 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BACE1P56817 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
BACE1P56817 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BACE1P56817 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BACE1P56817 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BACE1P56817 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BACE1P56817 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BACE1P56817 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BACE1P56817 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BACE1P56817 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BACE1P56817 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BACE1P56817 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BACE1P56817 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BACE1P56817 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BACE1P56817 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BACE1P56817 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BACE1P56817 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BACE1P56817 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BACE1P56817 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BACE1P56817 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
BACE1P56817 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
BACE1P56817 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BACE1P56817 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
BACE1P56817 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BACE1P56817 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BACE1P56817 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BACE1P56817 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
BACE1P56817 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BACE1P56817 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
BACE1P56817 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
BACE1P56817 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
BACE1P56817 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BACE1P56817 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BACE1P56817 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BACE1P56817 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
BACE1P56817 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BACE1P56817 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
BACE1P56817 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BACE1P56817 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BACE1P56817 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BACE1P56817 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BACE1P56817 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BACE1P56817 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BACE1P56817 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BACE1P56817 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BACE1P56817 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BACE1P56817 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BACE1P56817 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
BACE1P56817 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BACE1P56817 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BACE1P56817 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BACE1P56817 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BACE1P56817 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BACE1P56817 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BACE1P56817 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BACE1P56817 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BACE1P56817 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BACE1P56817 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
BACE1P56817 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BACE1P56817 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BACE1P56817 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BACE1P56817 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BACE1P56817 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BACE1P56817 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
BACE1P56817 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BACE1P56817 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BACE1P56817 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
BACE1P56817 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BACE1P56817 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BACE1P56817 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BACE1P56817 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BACE1P56817 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BACE1P56817 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BACE1P56817 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BACE1P56817 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BACE1P56817 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BACE1P56817 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BACE1P56817 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BACE1P56817 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BACE1P56817 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BACE1P56817 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BACE1P56817 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BACE1P56817 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BACE1P56817 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BACE1P56817 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BACE1P56817 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BACE1P56817 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BACE1P56817 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BACE1P56817 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BACE1P56817 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BACE1P56817 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BACE1P56817 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BACE1P56817 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BACE1P56817 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms