Protein–RNA interactions for Protein: P56693

SOX10, Transcription factor SOX-10, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX10P56693 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SOX10P56693 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SOX10P56693 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SOX10P56693 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SOX10P56693 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SOX10P56693 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SOX10P56693 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SOX10P56693 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SOX10P56693 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SOX10P56693 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SOX10P56693 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SOX10P56693 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SOX10P56693 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SOX10P56693 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SOX10P56693 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SOX10P56693 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SOX10P56693 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SOX10P56693 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SOX10P56693 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SOX10P56693 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SOX10P56693 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SOX10P56693 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SOX10P56693 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SOX10P56693 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SOX10P56693 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SOX10P56693 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SOX10P56693 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SOX10P56693 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SOX10P56693 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SOX10P56693 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SOX10P56693 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SOX10P56693 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SOX10P56693 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SOX10P56693 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SOX10P56693 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SOX10P56693 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SOX10P56693 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SOX10P56693 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SOX10P56693 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SOX10P56693 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SOX10P56693 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SOX10P56693 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SOX10P56693 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SOX10P56693 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SOX10P56693 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SOX10P56693 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SOX10P56693 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SOX10P56693 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SOX10P56693 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SOX10P56693 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SOX10P56693 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SOX10P56693 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SOX10P56693 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SOX10P56693 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SOX10P56693 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SOX10P56693 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SOX10P56693 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SOX10P56693 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SOX10P56693 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SOX10P56693 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SOX10P56693 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SOX10P56693 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SOX10P56693 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SOX10P56693 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SOX10P56693 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SOX10P56693 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SOX10P56693 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SOX10P56693 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SOX10P56693 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SOX10P56693 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SOX10P56693 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SOX10P56693 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SOX10P56693 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SOX10P56693 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SOX10P56693 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SOX10P56693 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SOX10P56693 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SOX10P56693 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SOX10P56693 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SOX10P56693 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SOX10P56693 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SOX10P56693 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SOX10P56693 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SOX10P56693 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SOX10P56693 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SOX10P56693 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SOX10P56693 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SOX10P56693 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SOX10P56693 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SOX10P56693 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SOX10P56693 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SOX10P56693 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SOX10P56693 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SOX10P56693 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SOX10P56693 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SOX10P56693 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SOX10P56693 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SOX10P56693 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SOX10P56693 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SOX10P56693 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms