Protein–RNA interactions for Protein: P56182

RRP1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP1P56182 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RRP1P56182 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RRP1P56182 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RRP1P56182 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RRP1P56182 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
RRP1P56182 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RRP1P56182 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RRP1P56182 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RRP1P56182 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RRP1P56182 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RRP1P56182 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RRP1P56182 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RRP1P56182 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RRP1P56182 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
RRP1P56182 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RRP1P56182 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
RRP1P56182 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RRP1P56182 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RRP1P56182 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RRP1P56182 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RRP1P56182 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
RRP1P56182 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RRP1P56182 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RRP1P56182 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RRP1P56182 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RRP1P56182 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RRP1P56182 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RRP1P56182 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RRP1P56182 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
RRP1P56182 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RRP1P56182 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RRP1P56182 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RRP1P56182 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RRP1P56182 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RRP1P56182 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RRP1P56182 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RRP1P56182 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
RRP1P56182 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
RRP1P56182 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
RRP1P56182 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
RRP1P56182 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RRP1P56182 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RRP1P56182 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RRP1P56182 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RRP1P56182 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RRP1P56182 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RRP1P56182 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RRP1P56182 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
RRP1P56182 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
RRP1P56182 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RRP1P56182 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RRP1P56182 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28■■■□□ 2.07
RRP1P56182 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
RRP1P56182 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RRP1P56182 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RRP1P56182 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RRP1P56182 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RRP1P56182 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
RRP1P56182 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RRP1P56182 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
RRP1P56182 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RRP1P56182 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RRP1P56182 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RRP1P56182 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RRP1P56182 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RRP1P56182 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RRP1P56182 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
RRP1P56182 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RRP1P56182 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RRP1P56182 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RRP1P56182 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RRP1P56182 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RRP1P56182 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RRP1P56182 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
RRP1P56182 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RRP1P56182 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RRP1P56182 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RRP1P56182 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RRP1P56182 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RRP1P56182 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RRP1P56182 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RRP1P56182 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RRP1P56182 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RRP1P56182 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RRP1P56182 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RRP1P56182 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RRP1P56182 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RRP1P56182 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RRP1P56182 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RRP1P56182 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RRP1P56182 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RRP1P56182 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RRP1P56182 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
RRP1P56182 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
RRP1P56182 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
RRP1P56182 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
RRP1P56182 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
RRP1P56182 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RRP1P56182 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RRP1P56182 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms