Protein–RNA interactions for Protein: P55809

OXCT1, Succinyl-CoA:3-ketoacid coenzyme A transferase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OXCT1P55809 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
OXCT1P55809 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
OXCT1P55809 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
OXCT1P55809 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
OXCT1P55809 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
OXCT1P55809 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
OXCT1P55809 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
OXCT1P55809 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
OXCT1P55809 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
OXCT1P55809 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
OXCT1P55809 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
OXCT1P55809 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
OXCT1P55809 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
OXCT1P55809 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
OXCT1P55809 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
OXCT1P55809 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
OXCT1P55809 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
OXCT1P55809 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
OXCT1P55809 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
OXCT1P55809 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
OXCT1P55809 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
OXCT1P55809 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
OXCT1P55809 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
OXCT1P55809 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
OXCT1P55809 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
OXCT1P55809 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
OXCT1P55809 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
OXCT1P55809 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
OXCT1P55809 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
OXCT1P55809 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
OXCT1P55809 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
OXCT1P55809 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
OXCT1P55809 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
OXCT1P55809 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
OXCT1P55809 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
OXCT1P55809 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
OXCT1P55809 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
OXCT1P55809 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
OXCT1P55809 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
OXCT1P55809 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
OXCT1P55809 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
OXCT1P55809 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
OXCT1P55809 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
OXCT1P55809 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
OXCT1P55809 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
OXCT1P55809 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
OXCT1P55809 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
OXCT1P55809 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
OXCT1P55809 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
OXCT1P55809 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
OXCT1P55809 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
OXCT1P55809 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
OXCT1P55809 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
OXCT1P55809 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
OXCT1P55809 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
OXCT1P55809 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
OXCT1P55809 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
OXCT1P55809 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
OXCT1P55809 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
OXCT1P55809 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
OXCT1P55809 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
OXCT1P55809 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
OXCT1P55809 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
OXCT1P55809 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
OXCT1P55809 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
OXCT1P55809 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
OXCT1P55809 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
OXCT1P55809 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
OXCT1P55809 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
OXCT1P55809 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
OXCT1P55809 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
OXCT1P55809 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
OXCT1P55809 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
OXCT1P55809 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
OXCT1P55809 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
OXCT1P55809 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
OXCT1P55809 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
OXCT1P55809 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
OXCT1P55809 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
OXCT1P55809 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
OXCT1P55809 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
OXCT1P55809 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
OXCT1P55809 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
OXCT1P55809 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
OXCT1P55809 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
OXCT1P55809 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
OXCT1P55809 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
OXCT1P55809 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
OXCT1P55809 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
OXCT1P55809 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
OXCT1P55809 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
OXCT1P55809 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
OXCT1P55809 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
OXCT1P55809 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
OXCT1P55809 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
OXCT1P55809 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
OXCT1P55809 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
OXCT1P55809 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
OXCT1P55809 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
OXCT1P55809 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms