Protein–RNA interactions for Protein: P55201

BRPF1, Peregrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF1P55201 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
BRPF1P55201 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
BRPF1P55201 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
BRPF1P55201 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
BRPF1P55201 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
BRPF1P55201 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
BRPF1P55201 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
BRPF1P55201 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
BRPF1P55201 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
BRPF1P55201 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
BRPF1P55201 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
BRPF1P55201 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
BRPF1P55201 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
BRPF1P55201 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
BRPF1P55201 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
BRPF1P55201 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
BRPF1P55201 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
BRPF1P55201 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
BRPF1P55201 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
BRPF1P55201 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
BRPF1P55201 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
BRPF1P55201 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
BRPF1P55201 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
BRPF1P55201 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
BRPF1P55201 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
BRPF1P55201 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
BRPF1P55201 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
BRPF1P55201 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
BRPF1P55201 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
BRPF1P55201 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
BRPF1P55201 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
BRPF1P55201 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
BRPF1P55201 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
BRPF1P55201 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
BRPF1P55201 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
BRPF1P55201 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
BRPF1P55201 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
BRPF1P55201 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
BRPF1P55201 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
BRPF1P55201 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
BRPF1P55201 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
BRPF1P55201 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
BRPF1P55201 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
BRPF1P55201 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
BRPF1P55201 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
BRPF1P55201 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
BRPF1P55201 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
BRPF1P55201 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
BRPF1P55201 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
BRPF1P55201 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
BRPF1P55201 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
BRPF1P55201 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
BRPF1P55201 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
BRPF1P55201 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
BRPF1P55201 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
BRPF1P55201 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
BRPF1P55201 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
BRPF1P55201 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
BRPF1P55201 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
BRPF1P55201 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
BRPF1P55201 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
BRPF1P55201 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
BRPF1P55201 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
BRPF1P55201 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
BRPF1P55201 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
BRPF1P55201 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
BRPF1P55201 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
BRPF1P55201 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
BRPF1P55201 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
BRPF1P55201 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
BRPF1P55201 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
BRPF1P55201 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
BRPF1P55201 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
BRPF1P55201 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
BRPF1P55201 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
BRPF1P55201 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
BRPF1P55201 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
BRPF1P55201 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
BRPF1P55201 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
BRPF1P55201 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
BRPF1P55201 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
BRPF1P55201 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
BRPF1P55201 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
BRPF1P55201 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
BRPF1P55201 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
BRPF1P55201 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
BRPF1P55201 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
BRPF1P55201 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
BRPF1P55201 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
BRPF1P55201 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
BRPF1P55201 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
BRPF1P55201 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
BRPF1P55201 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
BRPF1P55201 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
BRPF1P55201 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
BRPF1P55201 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
BRPF1P55201 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.04
BRPF1P55201 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
BRPF1P55201 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
BRPF1P55201 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms