Protein–RNA interactions for Protein: P54253

ATXN1, Ataxin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN1P54253 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATXN1P54253 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATXN1P54253 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATXN1P54253 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATXN1P54253 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATXN1P54253 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATXN1P54253 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATXN1P54253 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATXN1P54253 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATXN1P54253 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATXN1P54253 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATXN1P54253 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATXN1P54253 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATXN1P54253 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATXN1P54253 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATXN1P54253 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATXN1P54253 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATXN1P54253 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATXN1P54253 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATXN1P54253 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATXN1P54253 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATXN1P54253 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATXN1P54253 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATXN1P54253 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATXN1P54253 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATXN1P54253 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATXN1P54253 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATXN1P54253 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATXN1P54253 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ATXN1P54253 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATXN1P54253 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATXN1P54253 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATXN1P54253 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATXN1P54253 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATXN1P54253 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ATXN1P54253 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ATXN1P54253 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ATXN1P54253 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ATXN1P54253 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATXN1P54253 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATXN1P54253 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATXN1P54253 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ATXN1P54253 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATXN1P54253 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATXN1P54253 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATXN1P54253 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ATXN1P54253 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATXN1P54253 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATXN1P54253 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATXN1P54253 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATXN1P54253 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATXN1P54253 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATXN1P54253 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ATXN1P54253 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATXN1P54253 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATXN1P54253 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATXN1P54253 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATXN1P54253 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATXN1P54253 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATXN1P54253 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATXN1P54253 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATXN1P54253 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATXN1P54253 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATXN1P54253 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATXN1P54253 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATXN1P54253 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATXN1P54253 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATXN1P54253 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATXN1P54253 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATXN1P54253 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATXN1P54253 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATXN1P54253 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATXN1P54253 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATXN1P54253 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATXN1P54253 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATXN1P54253 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATXN1P54253 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATXN1P54253 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATXN1P54253 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATXN1P54253 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATXN1P54253 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATXN1P54253 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATXN1P54253 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATXN1P54253 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATXN1P54253 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATXN1P54253 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATXN1P54253 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ATXN1P54253 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATXN1P54253 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATXN1P54253 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATXN1P54253 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATXN1P54253 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATXN1P54253 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATXN1P54253 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATXN1P54253 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATXN1P54253 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATXN1P54253 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ATXN1P54253 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATXN1P54253 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATXN1P54253 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms