Protein–RNA interactions for Protein: P53384

NUBP1, Cytosolic Fe-S cluster assembly factor NUBP1, humanhuman

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUBP1P53384 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NUBP1P53384 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
NUBP1P53384 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NUBP1P53384 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NUBP1P53384 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NUBP1P53384 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
NUBP1P53384 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUBP1P53384 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUBP1P53384 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUBP1P53384 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUBP1P53384 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUBP1P53384 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUBP1P53384 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUBP1P53384 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUBP1P53384 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
NUBP1P53384 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUBP1P53384 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
NUBP1P53384 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUBP1P53384 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUBP1P53384 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUBP1P53384 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUBP1P53384 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUBP1P53384 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUBP1P53384 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUBP1P53384 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUBP1P53384 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUBP1P53384 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUBP1P53384 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUBP1P53384 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUBP1P53384 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUBP1P53384 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUBP1P53384 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUBP1P53384 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUBP1P53384 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUBP1P53384 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUBP1P53384 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUBP1P53384 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
NUBP1P53384 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUBP1P53384 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUBP1P53384 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUBP1P53384 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUBP1P53384 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
NUBP1P53384 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUBP1P53384 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUBP1P53384 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUBP1P53384 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUBP1P53384 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
NUBP1P53384 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUBP1P53384 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUBP1P53384 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NUBP1P53384 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUBP1P53384 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NUBP1P53384 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUBP1P53384 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUBP1P53384 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUBP1P53384 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUBP1P53384 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUBP1P53384 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUBP1P53384 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUBP1P53384 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
NUBP1P53384 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUBP1P53384 AC008686.1-203ENST00000591826 463 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUBP1P53384 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUBP1P53384 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUBP1P53384 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUBP1P53384 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUBP1P53384 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NUBP1P53384 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NUBP1P53384 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NUBP1P53384 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NUBP1P53384 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NUBP1P53384 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NUBP1P53384 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NUBP1P53384 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NUBP1P53384 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NUBP1P53384 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NUBP1P53384 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NUBP1P53384 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NUBP1P53384 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NUBP1P53384 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NUBP1P53384 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NUBP1P53384 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
NUBP1P53384 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
NUBP1P53384 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NUBP1P53384 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUBP1P53384 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUBP1P53384 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUBP1P53384 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUBP1P53384 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUBP1P53384 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUBP1P53384 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUBP1P53384 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUBP1P53384 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUBP1P53384 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUBP1P53384 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUBP1P53384 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUBP1P53384 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUBP1P53384 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUBP1P53384 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NUBP1P53384 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms