Protein–RNA interactions for Protein: P53365

ARFIP2, Arfaptin-2, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP2P53365 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARFIP2P53365 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARFIP2P53365 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARFIP2P53365 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARFIP2P53365 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARFIP2P53365 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARFIP2P53365 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARFIP2P53365 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARFIP2P53365 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARFIP2P53365 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARFIP2P53365 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARFIP2P53365 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARFIP2P53365 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARFIP2P53365 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARFIP2P53365 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ARFIP2P53365 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARFIP2P53365 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARFIP2P53365 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARFIP2P53365 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARFIP2P53365 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARFIP2P53365 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARFIP2P53365 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ARFIP2P53365 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARFIP2P53365 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARFIP2P53365 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARFIP2P53365 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARFIP2P53365 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ARFIP2P53365 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARFIP2P53365 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARFIP2P53365 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARFIP2P53365 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARFIP2P53365 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARFIP2P53365 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARFIP2P53365 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ARFIP2P53365 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARFIP2P53365 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARFIP2P53365 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ARFIP2P53365 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARFIP2P53365 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARFIP2P53365 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARFIP2P53365 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARFIP2P53365 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARFIP2P53365 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARFIP2P53365 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARFIP2P53365 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARFIP2P53365 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARFIP2P53365 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARFIP2P53365 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARFIP2P53365 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARFIP2P53365 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARFIP2P53365 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARFIP2P53365 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ARFIP2P53365 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ARFIP2P53365 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ARFIP2P53365 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ARFIP2P53365 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ARFIP2P53365 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ARFIP2P53365 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ARFIP2P53365 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ARFIP2P53365 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARFIP2P53365 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARFIP2P53365 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARFIP2P53365 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARFIP2P53365 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ARFIP2P53365 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
ARFIP2P53365 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARFIP2P53365 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARFIP2P53365 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARFIP2P53365 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ARFIP2P53365 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARFIP2P53365 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARFIP2P53365 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ARFIP2P53365 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ARFIP2P53365 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ARFIP2P53365 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARFIP2P53365 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARFIP2P53365 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARFIP2P53365 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARFIP2P53365 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ARFIP2P53365 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARFIP2P53365 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARFIP2P53365 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARFIP2P53365 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARFIP2P53365 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ARFIP2P53365 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ARFIP2P53365 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ARFIP2P53365 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ARFIP2P53365 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ARFIP2P53365 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ARFIP2P53365 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ARFIP2P53365 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ARFIP2P53365 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ARFIP2P53365 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ARFIP2P53365 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ARFIP2P53365 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ARFIP2P53365 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ARFIP2P53365 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ARFIP2P53365 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
ARFIP2P53365 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ARFIP2P53365 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms