Protein–RNA interactions for Protein: P52948

NUP98, Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96, humanhuman

Predictions only

Length 1,817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP98P52948 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NUP98P52948 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NUP98P52948 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NUP98P52948 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NUP98P52948 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NUP98P52948 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
NUP98P52948 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
NUP98P52948 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NUP98P52948 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NUP98P52948 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NUP98P52948 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NUP98P52948 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NUP98P52948 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
NUP98P52948 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NUP98P52948 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NUP98P52948 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NUP98P52948 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NUP98P52948 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NUP98P52948 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NUP98P52948 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NUP98P52948 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NUP98P52948 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NUP98P52948 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
NUP98P52948 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NUP98P52948 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NUP98P52948 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
NUP98P52948 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NUP98P52948 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NUP98P52948 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NUP98P52948 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NUP98P52948 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NUP98P52948 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NUP98P52948 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NUP98P52948 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NUP98P52948 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NUP98P52948 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NUP98P52948 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NUP98P52948 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NUP98P52948 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NUP98P52948 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
NUP98P52948 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NUP98P52948 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NUP98P52948 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NUP98P52948 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NUP98P52948 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NUP98P52948 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NUP98P52948 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NUP98P52948 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NUP98P52948 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
NUP98P52948 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NUP98P52948 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NUP98P52948 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NUP98P52948 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NUP98P52948 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NUP98P52948 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NUP98P52948 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NUP98P52948 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NUP98P52948 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NUP98P52948 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NUP98P52948 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NUP98P52948 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NUP98P52948 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NUP98P52948 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NUP98P52948 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NUP98P52948 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NUP98P52948 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NUP98P52948 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
NUP98P52948 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.97
NUP98P52948 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
NUP98P52948 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
NUP98P52948 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NUP98P52948 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NUP98P52948 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NUP98P52948 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NUP98P52948 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
NUP98P52948 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NUP98P52948 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NUP98P52948 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
NUP98P52948 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NUP98P52948 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NUP98P52948 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NUP98P52948 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NUP98P52948 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
NUP98P52948 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NUP98P52948 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NUP98P52948 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
NUP98P52948 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NUP98P52948 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NUP98P52948 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NUP98P52948 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NUP98P52948 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NUP98P52948 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
NUP98P52948 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NUP98P52948 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NUP98P52948 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NUP98P52948 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NUP98P52948 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NUP98P52948 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NUP98P52948 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NUP98P52948 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms