Protein–RNA interactions for Protein: P52790

HK3, Hexokinase-3, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HK3P52790 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HK3P52790 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HK3P52790 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HK3P52790 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HK3P52790 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
HK3P52790 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
HK3P52790 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HK3P52790 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HK3P52790 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HK3P52790 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HK3P52790 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HK3P52790 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HK3P52790 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HK3P52790 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HK3P52790 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HK3P52790 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
HK3P52790 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HK3P52790 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HK3P52790 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
HK3P52790 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HK3P52790 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HK3P52790 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HK3P52790 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HK3P52790 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HK3P52790 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HK3P52790 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HK3P52790 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HK3P52790 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HK3P52790 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HK3P52790 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HK3P52790 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HK3P52790 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HK3P52790 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HK3P52790 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HK3P52790 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HK3P52790 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HK3P52790 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HK3P52790 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HK3P52790 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HK3P52790 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HK3P52790 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HK3P52790 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HK3P52790 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HK3P52790 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HK3P52790 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HK3P52790 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
HK3P52790 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HK3P52790 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HK3P52790 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HK3P52790 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HK3P52790 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HK3P52790 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HK3P52790 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HK3P52790 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HK3P52790 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HK3P52790 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HK3P52790 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HK3P52790 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HK3P52790 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HK3P52790 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HK3P52790 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HK3P52790 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HK3P52790 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HK3P52790 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HK3P52790 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HK3P52790 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HK3P52790 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
HK3P52790 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
HK3P52790 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HK3P52790 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HK3P52790 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HK3P52790 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HK3P52790 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HK3P52790 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HK3P52790 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HK3P52790 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HK3P52790 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HK3P52790 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
HK3P52790 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HK3P52790 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HK3P52790 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HK3P52790 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HK3P52790 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HK3P52790 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HK3P52790 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HK3P52790 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HK3P52790 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HK3P52790 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HK3P52790 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HK3P52790 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HK3P52790 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HK3P52790 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HK3P52790 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HK3P52790 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HK3P52790 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HK3P52790 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
HK3P52790 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
HK3P52790 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HK3P52790 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HK3P52790 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms