Protein–RNA interactions for Protein: P51797

CLCN6, Chloride transport protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN6P51797 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLCN6P51797 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLCN6P51797 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLCN6P51797 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLCN6P51797 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLCN6P51797 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLCN6P51797 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLCN6P51797 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLCN6P51797 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLCN6P51797 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLCN6P51797 DCD-201ENST00000293371 645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLCN6P51797 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLCN6P51797 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLCN6P51797 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLCN6P51797 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLCN6P51797 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLCN6P51797 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLCN6P51797 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLCN6P51797 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLCN6P51797 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLCN6P51797 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLCN6P51797 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLCN6P51797 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLCN6P51797 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLCN6P51797 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLCN6P51797 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLCN6P51797 Metazoa_SRP.96-201ENST00000621315 318 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CLCN6P51797 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CLCN6P51797 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLCN6P51797 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLCN6P51797 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLCN6P51797 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLCN6P51797 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLCN6P51797 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLCN6P51797 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLCN6P51797 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLCN6P51797 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLCN6P51797 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLCN6P51797 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLCN6P51797 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLCN6P51797 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLCN6P51797 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CLCN6P51797 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLCN6P51797 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLCN6P51797 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLCN6P51797 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLCN6P51797 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLCN6P51797 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLCN6P51797 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLCN6P51797 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLCN6P51797 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLCN6P51797 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLCN6P51797 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLCN6P51797 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLCN6P51797 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLCN6P51797 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CLCN6P51797 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLCN6P51797 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLCN6P51797 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLCN6P51797 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLCN6P51797 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLCN6P51797 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLCN6P51797 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CLCN6P51797 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLCN6P51797 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLCN6P51797 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLCN6P51797 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLCN6P51797 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLCN6P51797 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLCN6P51797 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLCN6P51797 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLCN6P51797 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLCN6P51797 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLCN6P51797 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLCN6P51797 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLCN6P51797 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLCN6P51797 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLCN6P51797 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLCN6P51797 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLCN6P51797 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLCN6P51797 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLCN6P51797 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLCN6P51797 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLCN6P51797 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLCN6P51797 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLCN6P51797 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLCN6P51797 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLCN6P51797 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CLCN6P51797 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLCN6P51797 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLCN6P51797 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLCN6P51797 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLCN6P51797 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLCN6P51797 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLCN6P51797 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLCN6P51797 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLCN6P51797 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLCN6P51797 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLCN6P51797 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLCN6P51797 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms